Osam godina dva predsjednička mandata Mohammada Khatamija od 1997. do 2005. ponekad se naziva iranskom erom reformi.^[122] Predsjedavanje Mohammada Khatamija, koje je počelo 23. svibnja 1997., označilo je značajnu promjenu u iranskom političkom krajoliku, naglašavajući reforme i modernizaciju.Pobijedivši na izborima s nevjerojatnih 70% glasova uz visoku izlaznost od gotovo 80%, Khatamijeva pobjeda bila je poznata po širokoj podršci, uključujući tradicionalne ljevičare, poslovne vođe koji zagovaraju ekonomsku otvorenost i mlađe birače.^[123]Khatamijev izbor nagovijestio je želju za promjenom u iranskom društvu, posebice nakon Iransko- iračkog rata i razdoblja obnove nakon sukoba.Njegovo predsjedništvo, koje se često povezuje s "Pokretom 2. Khordad", bilo je usredotočeno na vladavinu prava, demokraciju i uključivo političko sudjelovanje.U početku je novo doba doživjelo značajnu liberalizaciju.Broj dnevnih novina koje izlaze u Iranu povećao se s pet na dvadeset i šest.Izdavanje časopisa i knjiga također je poraslo.Iranska filmska industrija doživjela je procvat pod Khatamijevim režimom, a iranski su filmovi osvojili nagrade u Cannesu i Veneciji.^[124] Međutim, njegov reformistički program često se sukobljavao s iranskim konzervativnim elementima, osobito onima na moćnim pozicijama poput Vijeća čuvara.Ti su sukobi često rezultirali Khatamijevim porazom u političkim borbama, što je dovodilo do razočaranja među njegovim pristašama.1999. godine stavljeni su novi rubnici na prešu.Sudovi su zabranili više od 60 novina.^[124] Važni saveznici predsjednika Khatamija uhićeni su, suđeni i zatvoreni na temelju onoga što su vanjski promatrači smatrali "izmišljenim" ^[125] ili ideološkim razlozima.Khatamijeva uprava bila je ustavno podređena vrhovnom vođi, ograničavajući njegovu vlast nad ključnim državnim institucijama.Njegov značajan zakonodavni pokušaj, "zakoni blizanci", imao je za cilj reformirati izborne zakone i razjasniti predsjedničke ovlasti.Te je zakone usvojio parlament, ali ih je Vijeće čuvara stavilo veto, simbolizirajući izazove s kojima se Khatami suočio u provedbi reformi.Khatamijevo predsjedništvo karakterizirao je naglasak na slobodi tiska, civilnom društvu, pravima žena, vjerskoj toleranciji i političkom razvoju.Nastojao je poboljšati imidž Irana na međunarodnoj razini, angažirajući se s Europskom unijom i postavši prvi iranski predsjednik koji je posjetio nekoliko europskih zemalja.Njegova ekonomska politika nastavila je industrijalizaciju napora prethodnih vlada, usredotočujući se na privatizaciju i integraciju iranskog gospodarstva u globalno tržište.Unatoč tim naporima, Iran se suočio sa značajnim izazovima, uključujući nezaposlenost i upornu borbu sa siromaštvom.U vanjskoj politici, Khatami je težio pomirenju umjesto sukoba, zagovarajući "Dijalog među civilizacijama" i pokušavajući popraviti odnose sa Zapadom.Nekoliko zemalja Europske unije počelo je obnavljati gospodarske veze s Iranom u kasnim 1990-ima, a trgovina i ulaganja su se povećali.Britanija je 1998. ponovno uspostavila diplomatske odnose s Iranom, prekinute od revolucije 1979. godine.Sjedinjene Države olabavile su svoj gospodarski embargo, ali su nastavile blokirati normalizaciju odnosa, tvrdeći da je zemlja upletena u međunarodni terorizam i da razvija kapacitete za nuklearno oružje.