גנואה ופיזה הפכו למדינות היחידות עם זכויות סחר בים השחור.באותה מאה הרפובליקה כבשה יישובים רבים בקרים, שם הוקמה המושבה הגנואית קפא.הברית עם האימפריה הביזנטית המשוקמת הגדילה את העושר והכוח של גנואה, ובמקביל הפחיתה את המסחר הוונציאני והפיזני.האימפריה הביזנטית העניקה את רוב זכויות המסחר החופשי לגנואה.בשנת 1282 ניסתה פיזה להשיג שליטה על המסחר והמינהל של קורסיקה, לאחר שנקראה לתמיכת השופט סינוצלו שהתקומם נגד גנואה.באוגוסט 1282, חלק מהצי הגנואי חסם את המסחר בפיזא ליד נהר ארנו.במהלך 1283 הן גנואה ופיזה עשו הכנות למלחמה.גנואה בנתה 120 גזיות, 60 מהן שייכות לרפובליקה, בעוד ש-60 הגלריות האחרות הושכרו ליחידים.יותר מ-15,000 שכירי חרב נשכרו כחותרים וחיילים.הצי הפיסני נמנע מקרב, וניסה לשחוק את הצי הגנואי במהלך 1283. ב-5 באוגוסט 1284, בקרב הימי על מלוריה, הצי הגנואי, המורכב מ-93 ספינות בראשות אוברטו דוריה ובנדטו הראשון זקריה, הביסה את הצי הפיסני. , שהורכבה מ-72 ספינות והובלה על ידי אלברטינו מורוסיני ואוגולינו דלה גררדסקה.גנואה כבשה 30 ספינות פיזניות, והטביעה שבע.כ-8,000 פיזנים נהרגו במהלך הקרב, יותר ממחצית מהחיילות של פיזנים, שהיו כ-14,000.התבוסה של פיזה, שמעולם לא התאוששה במלואה כמתחרה ימית, הובילה להשגת שליטה על המסחר של קורסיקה על ידי גנואה.העיירה סאסארי בסרדיניה, שהייתה בשליטת פיסאן, הפכה לקומונה או ל"עירייה חופשית" שנשלטה על ידי גנואה.השליטה בסרדיניה, לעומת זאת, לא עברה לצמיתות לגנואה: המלכים האראגונים של נאפולי חלקו על השליטה ולא הבטיחו אותה עד המאה החמש עשרה.