ב-1965, שר החוץ של פקיסטן זולפיקאר עלי בוטו, בעצרת הכללית של האו"ם ועם מדען האטום עזיז אחמד נוכח, הכריז על נחישותה של פקיסטן לפתח יכולת גרעינית אם הודו תעשה זאת, אפילו במחיר כלכלי גבוה.זה הוביל להרחבה של תשתית גרעינית עם שיתופי פעולה בינלאומיים.עם זאת, חוסר ההסכמה של בוטו עם הסכם טשקנט ב-1966 הוביל לפיטוריו על ידי הנשיא איוב חאן, ועורר הפגנות ושביתות ציבוריות המוניות."עשור הפיתוח" של איוב חאן ב-1968 התמודד עם התנגדות, כאשר סטודנטים שמאלנים תייגו אותו כ"עשור של דקדנס", ^[20] שביקרו את מדיניותו על טיפוח קפיטליזם של מקורבים ודיכוי אתני-לאומי. פערים כלכליים בין מערב ומזרח פקיסטן הזינו את הלאומיות הבנגלית , עם ליגת האוואמי, בראשות השייח' מוג'יבור רחמן, בדרישה לאוטונומיה. עליית הסוציאליזם ומפלגת העם של פקיסטן (PPP), שנוסדה על ידי בוטו, איתגרה עוד יותר את משטרו של חאן.ב-1967, ה-PPP ניצל את חוסר שביעות הרצון של הציבור, והוביל שביתות עובדים גדולות.למרות הדיכוי, קמה תנועה נרחבת ב-1968, שהחלישה את מעמדו של חאן;זה ידוע בתור תנועת 1968 בפקיסטן.^[21] תיק אגרטלה, שכלל מעצר מנהיגי ליגת אוואמי, הוסר בעקבות התקוממויות במזרח פקיסטן.בהתמודדות עם לחץ מה-PPP, תסיסה ציבורית וירידה בבריאות, התפטר חאן ב-1969, והעביר את השלטון לגנרל יחיא חאן, שהטיל אז חוק צבאי.