בינואר 1980, אינדירה גנדי וסיעתה בקונגרס הלאומי ההודי, המכונה "קונגרס(I)", חזרו לשלטון עם רוב ניכר.עם זאת, כהונתה התאפיינה באתגרים משמעותיים לביטחון הפנים של הודו, במיוחד מהתקוממויות בפנג'אב ובאסאם.בפנג'אב, עליית המרד היוותה איום רציני.חמושים שלחצו על חאליסטאן, מדינה ריבונית סיקית מוצעת, הפכו פעילים יותר ויותר.המצב הסלים באופן דרמטי עם מבצע כוכב כחול בשנת 1984. מבצע צבאי זה נועד לסלק חמושים חמושים שמצאו מקלט במקדש הזהב באמריצר, המקדש הקדוש ביותר לסיקיזם.המבצע הביא למותם של אזרחים וגרם לנזק ניכר למקדש, מה שהוביל לזעם וטינה נרחבת בקהילה הסיקה ברחבי הודו.לאחר מבצע "כוכב כחול" בוצעו פעולות משטרתיות אינטנסיביות שמטרתן לדכא פעילויות מיליטנטיות, אך מאמצים אלה היו פגומים בהאשמות רבות על הפרת זכויות אדם והפרות של חירויות האזרח.