בתקופת שלטונו של יוחנן השני קזימיר ואסה (ראשון 1648–1668), המלך השלישי והאחרון בשושלת שלו, ירדה הדמוקרטיה של האצילים כתוצאה מפלישות זרות ואי סדרים מבית.אסונות אלו התרבו באופן פתאומי למדי וסימנו את קץ תור הזהב הפולני.השפעתם הייתה להפוך את חבר העמים החזק שהיה פעם פגיע יותר ויותר להתערבות זרה.מרד חמלניצקי הקוזק בשנים 1648–1657 כבש את האזורים הדרום-מזרחיים של הכתר הפולני;השפעותיו ארוכות הטווח היו הרות אסון עבור חבר העמים.הווטו החופשי הראשון (אמצעי פרלמנטרי שאפשר לכל חבר בסי'ם לפזר מושב נוכחי לאלתר) הופעל על ידי סגן בשנת 1652. נוהג זה יחליש בסופו של דבר את השלטון המרכזי של פולין בצורה קריטית.בהסכם פריאסלב (1654), המורדים האוקראינים הכריזו על עצמם כנתינים של הצאר של רוסיה .מלחמת הצפון השנייה השתוללה בקרקעות הליבה של פולין בשנים 1655–1660;היא כללה פלישה אכזרית והרסנית לפולין המכונה המבול השוודי.במהלך המלחמות איבד חבר העמים כשליש מאוכלוסייתו וכן את מעמדו כמעצמה גדולה עקב פלישות של שוודיה ורוסיה.לדברי פרופסור אנדז'יי רוטרמונד, מנהל הטירה המלכותית בוורשה, הרס פולין במבול היה נרחב יותר מהרס המדינה במלחמת העולם השנייה.רוטרמונד טוען שפולשים שוודים שדדו מחבר העמים את העושר החשוב ביותר שלו, ורוב החפצים הגנובים מעולם לא חזרו לפולין.ורשה, בירת חבר העמים הפולני-ליטאי, נהרסה על ידי השוודים, ומתוך אוכלוסייה של 20,000 לפני המלחמה, נותרו בעיר רק 2,000 לאחר המלחמה.המלחמה הסתיימה ב-1660 עם הסכם אוליבה, שהביא לאובדן חלק מרכושה הצפוני של פולין.לפשיטות העבדים בקנה מידה גדול של הטטרים של קרים היו גם השפעות מזיקות מאוד על הכלכלה הפולנית.מרקוריוש פולסקי, העיתון הפולני הראשון, יצא לאור ב-1661.