Vuonna 1988 Pakistanissa demokratia palautettiin presidentti Zia-ul-Haqin kuoleman jälkeen järjestetyillä parlamenttivaaleilla.Nämä vaalit johtivat Pakistanin kansanpuolueen (PPP) palaamiseen valtaan, ja Benazir Bhuttosta tuli Pakistanin ensimmäinen naispuolinen pääministeri ja ensimmäinen naispuolinen hallituksen päämies muslimivaltaisessa maassa.Tälle vuoteen 1999 asti kestäneelle ajanjaksolle oli ominaista kilpaileva kaksipuoluejärjestelmä, jossa keskustaoikeistokonservatiivit johti Nawaz Sharif ja keskustavasemmistolaiset sosialistit Benazir Bhutton johdolla.Toimikautensa aikana Bhutto ohjasi Pakistanin kylmän sodan viimeisten vaiheiden läpi pitäen yllä länsimielistä politiikkaa yhteisen epäluottamuksen vuoksi kommunismia kohtaan.Hänen hallituksensa oli todistamassa Neuvostoliiton joukkojen vetäytymistä Afganistanista .Pakistanin atomipommiprojektin löytäminen johti kuitenkin kireyteen suhteisiin Yhdysvaltoihin ja taloudellisten pakotteiden määräämiseen.Bhutton hallitus kohtasi myös haasteita Afganistanissa, kun epäonnistunut sotilaallinen väliintulo johti tiedustelupalvelun johtajien erottamiseen.Huolimatta ponnisteluista talouden elvyttämiseksi, mukaan lukien seitsemännen viisivuotissuunnitelma, Pakistan koki stagflaatiota, ja konservatiivipresidentti Ghulam Ishaq Khan erotti lopulta Bhutton hallituksen.