Ayub Khanin Pakistanin sotatilan julistamista edeltävä ajanjakso oli poliittisen epävakauden ja sektanttisen politiikan leimaa.Hallitus, jonka katsottiin epäonnistuneen hallinnossaan, kohtasi ongelmia, kuten ratkaisemattomia kanavavesikiistoja, jotka vaikuttavat maataloudesta riippuvaiseen talouteen, ja haasteita Intian läsnäolon ratkaisemisessa Jammussa ja Kashmirissa.Vuonna 1956 Pakistan siirtyi brittiläisestä valtakunnasta islamilaiseksi tasavallaksi uudella perustuslailla, ja kenraalimajuri Iskander Mirzasta tuli ensimmäinen presidentti.Tänä aikana tapahtui kuitenkin merkittävää poliittista myllerrystä ja neljän pääministerin nopea peräkkäisyys kahden vuoden sisällä, mikä kiihotti väestöä ja armeijaa entisestään.Mirzan kiistanalainen vallankäyttö, erityisesti hänen One Unit -suunnitelmansa yhdistää Pakistanin maakunnat kahdeksi siiveksi, Itä- ja Länsi-Pakistaniksi, oli poliittisesti jakaa ja vaikea toteuttaa.Tämä myllerrys ja Mirzan toimet johtivat uskoon armeijassa, että vallankaappausta tuetaan yleisöltä, mikä tasoitti tietä Ayub Khanille omaksua vallan.Lokakuun 7. päivänä presidentti Mirza julisti sotatilan, kumosi vuoden 1956 perustuslain, erotti hallituksen, hajotti lainsäädäntöelimiä ja kielsi poliittiset puolueet.Hän nimitti kenraali Ayub Khanin sotatilalain päälliköksi ja ehdotti häntä uudeksi pääministeriksi.Sekä Mirza että Ayub Khan pitivät toisiaan kilpailijoina vallasta.Mirza, joka tunsi roolinsa muuttuvan tarpeettomaksi sen jälkeen, kun Ayub Khan oli ottanut suurimman osan toimeenpanovallasta sotatilalain pääjohtajana ja pääministerinä, yritti vahvistaa asemaansa.Sitä vastoin Ayub Khan epäili Mirzan juonittelun häntä vastaan.Raporttien mukaan Ayub Khanille ilmoitettiin Mirzan aikomuksesta pidättää hänet hänen palattuaan Dhakasta.Viime kädessä uskotaan yleisesti, että Ayub Khan pakotti Mirzan eroamaan uskollisten kenraalien tuella.^[14] Tämän jälkeen Mirza vietiin alun perin Quettaan, Baluchistanin pääkaupunkiin, ja sitten karkotettiin Lontooseen, Englantiin 27. marraskuuta, missä hän asui kuolemaansa asti vuonna 1969.Sotilasvallankaappaus otettiin alun perin vastaan ​​Pakistanissa hengähdystauona epävakaasta hallinnosta ja toivottiin talouden vakauttamista ja poliittista nykyaikaistamista.Ayub Khanin hallinto sai tukea ulkomaisilta hallituksilta, mukaan lukien Yhdysvallat .^[15] Hän yhdisti presidentin ja pääministerin roolit ja muodosti kabinetin teknokraateista, sotilasupseereista ja diplomaateista.Ayub Khan nimitti kenraali Muhammad Musan uudeksi armeijan päälliköksi ja varmisti oikeudellisen vahvistuksen hänen haltuunottolleen "välttämättömyyden opin" mukaisesti.