Michael IX Palaiologos oli Bysantin keisari yhdessä isänsä Andronikos II Palaiologoksen kanssa vuodesta 1294 kuolemaansa asti.Andronikos II ja Mikael IX hallitsivat tasavertaisina yhteishallitsijoina, molemmat käyttivät arvonimeä autokrator.Huolimatta sotilaallisesta arvovallastaan ​​hän kärsi useita tappioita epäselvistä syistä: kyvyttömyydestään komentajana, Bysantin armeijan valitettavasta tilasta tai yksinkertaisesti huonosta onnesta.Ainoa palaiologinen keisari, joka kuoli isänsä ennenaikaisesti, hänen ennenaikainen kuolemansa 43-vuotiaana johtui osittain surusta hänen nuoremman poikansa Manuel Palaiologoksen vahingossa murhasta hänen vanhemman poikansa ja myöhemmän keisarinsa Andronikos III Palaiologoksen pidättäjien toimesta.