Konfederaation joukot kaikkialla etelässä antautuivat, kun uutiset Leen antautumisesta saavuttivat heidät.26. huhtikuuta 1865, samana päivänä, kun Boston Corbett tappoi Boothin tupakkaladossa, kenraali Joseph E. Johnston luovutti lähes 90 000 Tennesseen armeijan sotilasta kenraalimajuri William Tecumseh Shermanille Bennett Placessa lähellä nykyistä Durhamia, Pohjois-Carolinassa.Se osoittautui konfederaation joukkojen suurimmaksi antautumiseksi.Toukokuun 4. päivänä kaikki jäljellä olevat konfederaation joukot Alabamassa, Louisianassa Mississippi-joen itäpuolella ja Mississippissä kenraaliluutnantti Richard Taylorin johdolla.Konfederaation presidentti Jefferson Davis vangittiin Irwinsvillessä, Georgiassa 10. toukokuuta 1865. 13. toukokuuta 1865 käytiin sodan viimeinen maataistelu Palmito Ranchin taistelussa Texasissa.26. toukokuuta 1865 konfederaation kenraaliluutnantti Simon B. Buckner, joka toimii kenraali Edmund Kirby Smithin nimissä, allekirjoitti sotilassopimuksen, jolla luovutettiin Konfederaation Trans-Mississippin osaston joukot.Aikalaiset ja historioitsijat mainitsevat tämän päivämäärän usein Yhdysvaltain sisällissodan päättymispäivänä.