En el año 1587 comenzó en la Commonwealth un período de gobierno bajo la Casa Sueca de Vasa. Los dos primeros reyes de esta dinastía, Segismundo III (r. 1587-1632) y Ladislao IV (r. 1632-1648), intentaron repetidamente intriga por el acceso al trono de Suecia, que era una fuente constante de distracción para los asuntos de la Commonwealth.En ese momento, la Iglesia católica se embarcó en una contraofensiva ideológica y la Contrarreforma se cobró muchos conversos de los círculos protestantes polacos y lituanos.En 1596, la Unión de Brest dividió a los cristianos orientales de la Commonwealth para crear la Iglesia uniata de rito oriental, pero sujeta a la autoridad del Papa.La rebelión de Zebrzydowski contra Segismundo III se desarrolló en 1606-1608.Buscando la supremacía en Europa del Este, la Commonwealth libró guerras con Rusia entre 1605 y 1618 a raíz de la época de los disturbios en Rusia;la serie de conflictos se conoce como la Guerra Polaco-Moscovita o las Dimitríadas.Los esfuerzos dieron como resultado la expansión de los territorios orientales de la Commonwealth polaco-lituana, pero no se logró el objetivo de asumir el trono ruso para la dinastía gobernante polaca.Suecia buscó la supremacía en el Báltico durante las guerras polaco-suecas de 1617-1629, y el Imperio Otomano presionó desde el sur en las batallas de Cecora en 1620 y Khotyn en 1621. La expansión agrícola y las políticas de servidumbre en la Ucrania polaca dieron como resultado una serie de de los levantamientos cosacos .Aliada con la monarquía de los Habsburgo, la Commonwealth no participó directamente en laGuerra de los Treinta Años. El IV reinado de Władysław fue mayormente pacífico, con una invasión rusa en la forma de la Guerra de Smolensk de 1632-1634 repelida con éxito.La jerarquía de la Iglesia Ortodoxa, prohibida en Polonia después de la Unión de Brest, se restableció en 1635.