Ο εμφύλιος πόλεμος μεταξύ των δυναστείων Lê-Trịnh και Mạc έληξε το 1592, όταν ο στρατός του Trịnh Tùng κατέκτησε το Ανόι και εκτέλεσε τον βασιλιά Mạc Mậu Hợp.Οι επιζώντες της βασιλικής οικογένειας Mạc κατέφυγαν στα βόρεια βουνά στην επαρχία Cao Bằng και συνέχισαν να κυβερνούν εκεί μέχρι το 1677, όταν ο Trịnh Tạc κατέκτησε αυτή την τελευταία επικράτεια Mạc.Οι μονάρχες Lê, από την αποκατάσταση του Nguyễn Kim, λειτουργούσαν μόνο ως κεφαλές.Μετά την πτώση της δυναστείας Mạc, όλη η πραγματική εξουσία στο βορρά ανήκε στους άρχοντες του Trịnh.Εν τω μεταξύ, το δικαστήριο του Μινγκ αποφάσισε απρόθυμα μια στρατιωτική επέμβαση στον εμφύλιο πόλεμο του Βιετνάμ, αλλά ο Mạc Đăng Dung προσέφερε τελετουργική υποταγή στην Αυτοκρατορία Μινγκ , η οποία έγινε αποδεκτή.Το έτος 1600, ο Nguyễn Hoàng δήλωσε επίσης τον εαυτό του Κύριο (επίσημα "Vương") και αρνήθηκε να στείλει περισσότερα χρήματα ή στρατιώτες για να βοηθήσει το Trịnh.Μετέφερε επίσης την πρωτεύουσά του στο Phú Xuân, το σύγχρονο Huế.Ο Trịnh Tráng διαδέχθηκε τον Trịnh Tùng, τον πατέρα του, μετά το θάνατό του το 1623. Ο Tráng διέταξε τον Nguyễn Phúc Nguyên να υποταχθεί στην εξουσία του.Η παραγγελία απορρίφθηκε δύο φορές.Το 1627, ο Trịnh Tráng έστειλε 150.000 στρατιώτες προς τα νότια σε μια ανεπιτυχή στρατιωτική εκστρατεία.Οι Trịnh ήταν πολύ ισχυρότεροι, με μεγαλύτερο πληθυσμό, οικονομία και στρατό, αλλά δεν μπόρεσαν να νικήσουν τους Nguyễn, οι οποίοι είχαν χτίσει δύο αμυντικούς πέτρινους τοίχους και επένδυσαν στο πορτογαλικό πυροβολικό.Ο πόλεμος Trịnh–Nguyễn διήρκεσε από το 1627 έως το 1672. Ο στρατός Trịnh πραγματοποίησε τουλάχιστον επτά επιθέσεις, όλες από τις οποίες απέτυχαν να καταλάβουν το Phú Xuân.Για ένα διάστημα, ξεκινώντας από το 1651, οι ίδιοι οι Nguyễn πήγαν στην επίθεση και επιτέθηκαν σε τμήματα της επικράτειας Trịnh.Ωστόσο, το Trịnh, υπό έναν νέο ηγέτη, τον Trịnh Tạc, ανάγκασε τους Nguyễn να επιστρέψουν το 1655. Μετά από μια τελευταία επίθεση το 1672, ο Trịnh Tạc συμφώνησε σε ανακωχή με τον Λόρδο Nguyễn Nguyễn Phn.Η χώρα ουσιαστικά χωρίστηκε στα δύο.Ο πόλεμος Trịnh–Nguyễn έδωσε στους Ευρωπαίους εμπόρους τις ευκαιρίες να υποστηρίξουν κάθε πλευρά με όπλα και τεχνολογία: οι Πορτογάλοι βοήθησαν τους Nguyễn στο Νότο ενώ οι Ολλανδοί βοήθησαν το Trịnh στο Βορρά.Το Trịnh και το Nguyễn διατήρησαν μια σχετική ειρήνη για τα επόμενα εκατό χρόνια, κατά τη διάρκεια των οποίων και οι δύο πλευρές έκαναν σημαντικά επιτεύγματα.Το Trịnh δημιούργησε κεντρικά κυβερνητικά γραφεία επιφορτισμένα με τον κρατικό προϋπολογισμό και την παραγωγή νομίσματος, ενοποίησε τις μονάδες βάρους σε ένα δεκαδικό σύστημα, ίδρυσε τυπογραφεία για να μειώσει την ανάγκη εισαγωγής έντυπου υλικού από την Κίνα, άνοιξε μια στρατιωτική ακαδημία και συνέταξε βιβλία ιστορίας.Εν τω μεταξύ, οι άρχοντες του Nguyễn συνέχισαν την επέκταση προς τα νότια με την κατάκτηση της υπόλοιπης γης των Τσαμ.Οι άποικοι Việt έφτασαν επίσης στην αραιοκατοικημένη περιοχή γνωστή ως "Water Chenla", η οποία ήταν το κατώτερο τμήμα του Δέλτα του Μεκόνγκ της πρώην Αυτοκρατορίας των Χμερ .Από τα μέσα του 17ου αιώνα έως τα μέσα του 18ου αιώνα, καθώς η πρώην αυτοκρατορία των Χμερ αποδυναμώθηκε από εσωτερικές διαμάχες και εισβολές Σιάμ , οι Λόρδοι Nguyễn χρησιμοποίησαν διάφορα μέσα, πολιτικό γάμο, διπλωματική πίεση, πολιτικές και στρατιωτικές χάρες, για να κερδίσουν την περιοχή γύρω από το παρόν -Ημέρα Σαϊγκόν και Δέλτα του Μεκόνγκ.Ο στρατός Nguyễn κατά καιρούς συγκρούστηκε επίσης με τον σιαμαίο στρατό για να δημιουργήσει επιρροή στην πρώην αυτοκρατορία των Χμερ.