Στις γενικές εκλογές του 1993, το κόμμα της Μπεναζίρ Μπούτο εξασφάλισε έναν πλουραλισμό, με αποτέλεσμα να σχηματίσει κυβέρνηση και να επιλέξει πρόεδρο.Διόρισε και τους τέσσερις αρχηγούς του επιτελείου – Mansurul Haq (Ναυτικό), Abbas Khattak (Αεροπορία), Abdul Waheed (Στρατός) και Farooq Feroze Khan (Κοινοί Αρχηγοί).Η σταθερή προσέγγιση της Μπούτο στην πολιτική σταθερότητα και η δυναμική ρητορική της της κέρδισαν το παρατσούκλι «Σιδηρά Κυρία» από τους αντιπάλους της.Υποστήριξε τη σοσιαλδημοκρατία και την εθνική υπερηφάνεια, συνεχίζοντας την οικονομική εθνικοποίηση και συγκεντρωτισμό στο πλαίσιο του Όγδοου Πενταετούς Σχεδίου για την καταπολέμηση του στασιμοπληθωρισμού.Η εξωτερική της πολιτική προσπάθησε να εξισορροπήσει τις σχέσεις με το Ιράν , τις Ηνωμένες Πολιτείες , την Ευρωπαϊκή Ένωση και τα σοσιαλιστικά κράτη.Κατά τη διάρκεια της θητείας του Μπούτο, η υπηρεσία πληροφοριών του Πακιστάν, η Inter-Services Intelligence (ISI), συμμετείχε ενεργά στην υποστήριξη των μουσουλμανικών κινημάτων παγκοσμίως.Αυτό περιελάμβανε την αψήφηση του εμπάργκο όπλων του ΟΗΕ για να βοηθήσουν τους Βόσνιους Μουσουλμάνους, ^[22] εμπλοκή στο Xinjiang, τις Φιλιππίνες και την Κεντρική Ασία, ^[23] και την αναγνώριση της κυβέρνησης των Ταλιμπάν στο Αφγανιστάν .Ο Μπούτο διατήρησε επίσης πίεση στην Ινδία σχετικά με το πυρηνικό της πρόγραμμα και προώθησε τις πυρηνικές και πυραυλικές δυνατότητες του ίδιου του Πακιστάν, συμπεριλαμβανομένης της εξασφάλισης τεχνολογίας πρόωσης ανεξάρτητης από την Αέρα από τη Γαλλία.Πολιτιστικά, οι πολιτικές του Μπούτο ώθησαν την ανάπτυξη στις βιομηχανίες της ροκ και της ποπ μουσικής και αναζωογόνησαν την κινηματογραφική βιομηχανία με νέα ταλέντα.Απαγόρευσε τα ινδικά μέσα ενημέρωσης στο Πακιστάν ενώ προώθησε τοπική τηλεόραση, δράματα, ταινίες και μουσική.Τόσο ο Μπούτο όσο και ο Σαρίφ παρείχαν ουσιαστική ομοσπονδιακή υποστήριξη για την εκπαίδευση και την έρευνα στην επιστήμη λόγω των ανησυχιών του κοινού για τις αδυναμίες του εκπαιδευτικού συστήματος.Ωστόσο, η δημοτικότητα της Μπούτο μειώθηκε μετά τον αμφιλεγόμενο θάνατο του αδελφού της Μουρτάζα Μπούτο, με τις υποψίες για τη συμμετοχή της, αν και αναπόδεικτες.Το 1996, μόλις επτά εβδομάδες μετά τον θάνατο του Μουρτάζα, η κυβέρνηση του Μπούτο απολύθηκε από τον πρόεδρο που είχε ορίσει, εν μέρει λόγω κατηγοριών που σχετίζονται με τον θάνατο του Μουρτάζα Μπούτο.