Eine Studie zur asiatischen Genetik legt nahe, dass die ursprünglichen Menschen in Ostasien aus Südostasien stammten.^[14] Die indigenen Gruppen auf der Halbinsel lassen sich in drei Ethnien einteilen: die Negritos, die Senoi und die Proto-Malaysier.^[15] Die ersten Bewohner der malaiischen Halbinsel waren höchstwahrscheinlich Negritos.^[16] Diese mesolithischen Jäger waren wahrscheinlich die Vorfahren der Semang, einer ethnischen Negrito-Gruppe.^[17] Die Senoi scheinen eine zusammengesetzte Gruppe zu sein, wobei etwa die Hälfte der mütterlichen mitochondrialen DNA-Abstammungslinien auf die Vorfahren der Semang und etwa die Hälfte auf spätere Ahnenwanderungen aus Indochina zurückgehen.Wissenschaftler gehen davon aus, dass es sich um Nachkommen früher österreichischsprachiger Landwirte handelt, die vor etwa 4.000 Jahren sowohl ihre Sprache als auch ihre Technologie in den südlichen Teil der Halbinsel brachten.Sie schlossen sich mit der indigenen Bevölkerung zusammen und verschmolzen mit ihr.^[18] Die Proto-Malaysier haben einen vielfältigeren Ursprung ^[19] und hatten sich infolge der austronesischen Expansion um 1000 v. Chr. in Malaysia niedergelassen.^[20] Obwohl sie einige Verbindungen zu anderen Bewohnern im maritimen Südostasien aufweisen, haben einige auch eine Abstammung aus Indochina zur Zeit des letzten Eiszeitmaximums vor etwa 20.000 Jahren.Gebiete, die das heutige Malaysia umfassen, beteiligten sich an der Maritime Jade Road.Das Handelsnetzwerk existierte 3.000 Jahre lang, zwischen 2000 v. Chr. und 1000 n. Chr.^[21]Anthropologen unterstützen die Annahme, dass die Proto-Malaysier aus dem heutigen Yunnan inChina stammten.^[22] Es folgte eine Ausbreitung im frühen Holozän über die Malaiische Halbinsel in den Malaiischen Archipel.^[23] Um 300 v. Chr. wurden sie von den Deutero-Malaysern, einem Volk aus der Eisen- oder Bronzezeit, das teilweise von den Cham in Kambodscha und Vietnam abstammte, ins Landesinnere gedrängt.Die Deutero-Malaysier waren die erste Gruppe auf der Halbinsel, die Metallwerkzeuge verwendete. Sie waren die direkten Vorfahren der heutigen Malaysier und brachten fortschrittliche landwirtschaftliche Techniken mit.^[17] Die Malaien blieben im gesamten malaiischen Archipel politisch fragmentiert, obwohl sie eine gemeinsame Kultur und soziale Struktur hatten.^[24]