Ved rigsdagen i marts 1467 blev to traditionelle skatter omdøbt;kammerets overskud blev derefter opkrævet som skat af den kongelige kasse og den tredivte som kronens told.På grund af denne ændring blev alle tidligere skattefritagelser ugyldige, hvilket øgede statens indtægter.Matthias gik i gang med at centralisere administrationen af ​​kongelige indtægter.Han betroede administrationen af ​​kronens told til John Ernuszt, en omvendt jødisk købmand.Inden for to år var Ernuszt ansvarlig for opkrævningen af ​​alle almindelige og ekstraordinære skatter og forvaltningen af ​​saltminerne.Matthias' skattereform forårsagede et oprør i Transsylvanien.Repræsentanterne for provinsens "Tre Nationer" - adelsmændene, sakserne og Székelys - dannede en alliance mod kongen i Kolozsmonostor (nu Mănăștur-distriktet i Cluj-Napoca, Rumænien) den 18. august og erklærede, at de var villige til at kæmpe for Ungarns frihed.Matthias samlede straks sine tropper og skyndte sig til provinsen.Oprørerne overgav sig uden modstand, men Matthias straffede deres ledere hårdt, hvoraf mange blev spiddet, halshugget eller nådesløst tortureret efter hans ordre.I mistanke om, at Stephen den Store havde støttet oprøret, invaderede Matthias Moldavien.Stephens styrker styrtede imidlertid Matthias' i slaget ved Baia den 15. december 1467. Matthias led alvorlige skader, hvilket tvang ham til at vende tilbage til Ungarn.