I 1965 erklærede Pakistans udenrigsminister Zulfikar Ali Bhutto på FN's Generalforsamling og med atomforsker Aziz Ahmed til stede Pakistans vilje til at udvikle en nuklear kapacitet, hvis Indien gjorde det, selv med store økonomiske omkostninger.Dette førte til udvidet nuklear infrastruktur med internationale samarbejder.Imidlertid førte Bhuttos uenighed med Tashkent-aftalen i 1966 til hans afskedigelse af præsident Ayub Khan, hvilket udløste offentlige massedemonstrationer og strejker.Ayub Khans "Decade of Development" i 1968 mødte modstand, hvor venstreorienterede studerende betegnede det som et "Decade of Decadence", ^[20] og kritiserede hans politik for at fremme kammeratkapitalisme og etnisk-nationalistisk undertrykkelse. Økonomiske uligheder mellem Vest- og Østpakistan gav næring til den bengalske nationalisme , med Awami Ligaen, ledet af Sheikh Mujibur Rahman, der krævede autonomi. Socialismens fremkomst og Pakistan People's Party (PPP), grundlagt af Bhutto, udfordrede Khans regime yderligere.I 1967 udnyttede OPP på offentlig utilfredshed og førte til store arbejdsstrejker.På trods af undertrykkelse opstod en udbredt bevægelse i 1968, hvilket svækkede Khans position;det er kendt som 1968-bevægelsen i Pakistan.^[21] Agartala-sagen, som involverede arrestation af Awami League-ledere, blev trukket tilbage efter opstande i Østpakistan.Da han stod over for pres fra PPP, offentlig uro og faldende helbred, trådte Khan tilbage i 1969 og overdrog magten til general Yahya Khan, som derefter indførte krigslov.