Under Anden Verdenskrig besatteItalien under Benito Mussolini Montenegro i 1941 og annekterede til Kongeriget Italien området Kotor (Cattaro), hvor der var en lille venetiansktalende befolkning.Dukkekongeriget Montenegro blev skabt under fascistisk kontrol, mens Krsto Zrnov Popović vendte tilbage fra sit eksil i Rom i 1941 for at forsøge at lede Zelenaši ("Det grønne" parti), som støttede genindsættelsen af ​​det montenegrinske monarki.Denne milits blev kaldt Lovćen Brigade.Montenegro blev hærget af en frygtelig guerillakrig, primært efter at Nazityskland erstattede de besejrede italienere i september 1943.Under Anden Verdenskrig, som det var tilfældet i mange andre dele af Jugoslavien, var Montenegro involveret i en form for borgerkrig.Udover de grønne montenegrinske var de to hovedfraktioner den chetnikiske jugoslaviske hær, som svor troskab til eksilregeringen og hovedsageligt bestod af montenegrinere, der erklærede sig som serbere (mange af dens medlemmer var montenegrinske hvide) og jugoslaviske partisaner, hvis mål var skabelsen af et socialistisk Jugoslavien efter krigen.Da begge fraktioner delte nogle ligheder i deres mål, især dem vedrørende et forenet Jugoslavien og anti-akse-modstand, gik de to sider sammen og startede i 1941 den 13. juli-opstand, den første organiserede opstand i det besatte Europa.Dette skete kun to måneder efter, at Jugoslavien kapitulerede og befriede det meste af montenegrinsk territorium, men oprørerne var ude af stand til at genvinde kontrollen over større byer.Efter de mislykkede forsøg på at befri byerne Pljevlja og Kolasin, generobrede italienerne, forstærket af tyskere, alt oprørernes territorium.På lederniveau førte uenigheder om statspolitik (centralistisk monarki vs. føderal socialistisk republik) til sidst til en splittelse mellem de to sider;de blev så fjender derfra.Konstant forsøgte begge fraktioner at vinde støtte blandt befolkningen.Men til sidst mistede Chetniks i Montenegro støtte blandt befolkningen, ligesom andre Chetnik-fraktioner i Jugoslavien.Den de facto leder af Chetniks i Montenegro, Pavle Djurisic, blev sammen med andre fremtrædende personer i bevægelsen som Dusan Arsovic og Đorđe Lašić holdt ansvarlige for massakrer på muslimsk befolkning i det østlige Bosnien og Sandzak i løbet af 1944. Deres ideologi om et homogent Serbien inden for Jugoslavien viste sig at være en stor hindring for at rekruttere liberale, minoriteter og montenegrinere, der betragtede Montenegro som en nation med sin egen identitet.Disse faktorer, udover at nogle tsjetnikere forhandlede med aksen, førte til, at den jugoslaviske hær i Chetnik mistede støtte blandt de allierede i 1943. Samme år kapitulerede Italien, som indtil da havde ansvaret for den besatte zone. og blev erstattet af Tyskland, og kampene fortsatte.Podgorica blev befriet af de socialistiske partisaner den 19. december 1944, og befrielseskrigen var vundet.Josip Broz Tito anerkendte Montenegros massive bidrag til krigen mod aksemagterne ved at etablere den som en af ​​de seks republikker i Jugoslavien.