I 538 f.v.t. erobrede Kyros den Store fra det Achaemenidiske Rige Babylon og indlemmet det i sit imperium.Hans udstedelse af en proklamation, Kyros-ediktet, gav religionsfrihed til dem under babylonisk styre.Dette gjorde det muligt for jødiske eksil i Babylon, inklusive 50.000 judæere ledet af Zerubabel, at vende tilbage til Juda og genopbygge Jerusalems tempel, færdiggjort omkring 515 fvt.^[80] Derudover vendte en anden gruppe på 5.000, ledet af Ezra og Nehemias, tilbage i 456 fvt;førstnævnte fik til opgave af den persiske konge at håndhæve religiøse regler, mens sidstnævnte blev udnævnt til guvernør med en mission om at genoprette byens mure.^[81] Yehud, som regionen blev kendt, forblev en Achaemenid-provins indtil 332 fvt.Toraens endelige tekst, der svarer til de første fem bøger i Bibelen, menes at være blevet udarbejdet i den persiske periode (omkring 450-350 f.v.t.) gennem redigering og forening af tidligere tekster.^[82] De hjemvendte israelitter adopterede en aramæisk skrift fra Babylon, nu den moderne hebraiske skrift, og den hebraiske kalender, der ligner den babylonske kalender, stammer sandsynligvis fra denne periode.^[83]Bibelen fortæller om spændinger mellem de hjemvendte, den første tempelperiodes elite ^[84] og dem, der blev i Juda.^[85] De hjemvendte, muligvis støttet af det persiske monarki, kunne være blevet betydelige godsejere, til skade for dem, der havde fortsat med at bearbejde jorden i Juda.Deres modstand mod det andet tempel kan afspejle frygt for at miste jordrettigheder på grund af udelukkelse fra kulten.^[84] Juda blev reelt et teokrati, ledet af arvelige ypperstepræster ^[86] og en persisk-udnævnt, ofte jødisk, guvernør, der var ansvarlig for at opretholde orden og sørge for tributbetalinger.^[87] Det er væsentligt, at en jydsk militærgarnison blev stationeret af perserne på Elephantine Island nær Aswan iEgypten .