Efter en lang periode med sikkert romersk styre var Pannonien fra 320'erne igen i hyppig krig med de østgermanske og sarmatiske folk mod nord og øst.Både vandalerne og goterne marcherede gennem provinsen og forårsagede enorme ødelæggelser.^[6] Efter opdelingen af ​​Romerriget forblev Pannonien under det vestromerske imperiums herredømme, selvom distriktet Sirmium faktisk var mere i østens indflydelsessfære.Da den latinske befolkning i provinsen flygtede fra de fortsatte barbariske indtrængen, ^[7] begyndte hunniske grupper at dukke op på kanten af ​​Donau.I 375 e.Kr. begyndte de nomadiske hunnere at invadere Europa fra de østlige stepper, hvilket anstiftede den store folkevandringstid.I 380 trængte hunnerne ind i det nuværende Ungarn og forblev en vigtig faktor i regionen langt ind i det 5. århundrede.De pannoniske provinser led under folkevandringsperioden fra 379 og frem, bosættelsen af ​​den allierede Goth-Alan-Hun forårsagede gentagne alvorlige kriser og ødelæggelser, samtiden beskrev det som en belejringstilstand, Pannonien blev en invasionskorridor både i nord og i syden.Romernes flugt og emigration begyndte efter to hårde årtier i 401, dette forårsagede også en recession i det verdslige og kirkelige liv.Hunernes kontrol udvidede sig gradvist over Pannonien fra 410, til sidst ratificerede Romerriget Pannoniens afståelse ved traktat i 433. Romernes flugt og emigration fra Pannonien fortsatte uden afbrydelse indtil invasionen af ​​Avarerne.Hunnerne udnyttede Goternes afgang, Quadi, et al., skabte et betydeligt imperium i 423 med base i Ungarn.I 453 nåede de højden af ​​deres ekspansion under den velkendte erobrer, Hunneren Attila.Imperiet brød sammen i 455, da hunnerne blev besejret af de tilstødende germanske stammer (såsom Quadi, Gepidi og Sciri).