Med den joniske flådes nederlag i slaget ved Lade var oprøret reelt slut.Milet var tæt investeret, og perserne "minede murene og brugte enhver anordning mod den, indtil de fuldstændig fangede den".Ifølge Herodot blev de fleste af mændene dræbt, og kvinderne og børnene blev gjort til slaver.Arkæologiske beviser underbygger delvist dette og viser udbredte tegn på ødelæggelse og opgivelse af store dele af byen i kølvandet på Lade.Nogle milesere forblev dog i (eller vendte hurtigt tilbage til) Milet, selvom byen aldrig ville generobre sin tidligere storhed.Milet blev således teoretisk "efterladt tom for milesere";perserne tog byen og kystlandet for sig selv og gav resten af ​​det milesiske område til Carians fra Pedasus.De fangede Milesianere blev bragt for Darius i Susa, som bosatte dem ved "Ampé" på kysten af ​​den Persiske Golf, nær udmundingen af ​​Tigris.Mange samere var rystede over deres generalers handlinger ved Lade og besluttede at emigrere, før deres gamle tyran, Aeaces of Samos, vendte tilbage for at regere dem.De tog imod en invitation fra Zancles befolkning om at slå sig ned på Siciliens kyst, og tog med sig de milesere, der havde formået at flygte fra perserne.Samos selv blev skånet for ødelæggelse af perserne på grund af samernes afhopp ved Lade.Det meste af Caria overgav sig nu til perserne, selvom nogle højborge måtte erobres med magt.