Det er tydeligt, at de demoraliserede og trætte grækere ikke var nogen match for perserne , og de blev fuldstændig forkastet i slaget, der fulgte ved Efesos.Mange blev dræbt, inklusive den eretriske general Eualcides.Ionerne, der undslap slaget, søgte deres egne byer, mens de resterende athenere og eretrere formåede at vende tilbage til deres skibe og sejlede tilbage til Grækenland.Athenerne afsluttede nu deres alliance med ionerne, da perserne havde vist sig at være alt andet end det lette bytte, som Aristagoras havde beskrevet.Men jonerne forblev engageret i deres oprør, og perserne så ikke ud til at følge op på deres sejr ved Efesos.Formentlig var disse ad hoc-styrker ikke udstyret til at belejre nogen af ​​byerne.På trods af nederlaget ved Efesos spredte oprøret sig faktisk yderligere.Ionerne sendte mænd til Hellespont og Propontis og erobrede Byzans og de andre nærliggende byer.De overtalte også karianerne til at slutte sig til oprøret.Da oprøret blev udbredt, gjorde Cyperns kongeriger desuden oprør mod det persiske styre uden nogen udefrakommende overtalelse.Slaget ved Efesos havde således ikke nogen større effekt på oprøret.