Jackson erfarede klokken 7, at Federals nærmede sig hans kolonne.Uden ordentlig rekognoscering eller at vente på, at hovedparten af ​​hans styrke skulle komme op, beordrede han Winders Stonewall Brigade til at storme gennem den tyndere tåge.Brigaden blev fanget mellem artilleri på sin flanke og riffelsalver foran og faldt tilbage i uorden.De var stødt ind i to brigader ved fortroppen af ​​Shields's hær, 3.000 mand under brig.Gen. Erastus B. Tyler.I et forsøg på at komme ud af en potentiel katastrofe indså Jackson, at Unionens artilleriild kom fra en udløber af Blue Ridge.Jackson og Winder sendte 2. og 4. Virginia infanteriregimenter gennem det tykke kratt op ad bakken, hvor de stødte på tre Unionens infanteriregimenter, der støttede artilleriet, og blev slået tilbage.Efter at hans angreb på Coaling mislykkedes, beordrede Jackson resten af ​​Ewells division, primært Trimbles brigade, til at krydse over North River-broen og brænde den bag sig og holde Frémonts mænd isoleret nord for floden.Mens han ventede på, at disse tropper skulle ankomme, forstærkede Jackson sin linje med det 7. Louisiana-infanteri fra Taylors brigade og beordrede Taylor til at gøre endnu et forsøg mod Unionens batterier.Winder opfattede, at Federals var ved at angribe, så han beordrede en forebyggende angreb, men i lyset af skarpe salver og ved at løbe tør for ammunition, blev Stonewall Brigade dirigeret.På dette tidspunkt ankom Ewell til slagmarken og beordrede 44. og 58. Virginia infanteriregimenter til at angribe venstre flanke af den fremrykkende Unions slaglinje.Tylers mænd faldt tilbage, men reorganiserede sig og drev Ewells mænd ind i skoven syd for Coaling.Taylor angreb infanteriet og artilleriet på Coaling tre gange før han sejrede, men efter at have nået deres mål, blev han konfronteret med en ny angreb fra tre Ohio-regimenter.Det var kun den overraskende optræden af ​​Ewells tropper, der overbeviste Tyler om at trække sine mænd tilbage.De konfødererede begyndte at bombardere unionstropperne på de flade områder, hvor Ewell selv glædeligt bemandede en af ​​kanonerne.Flere konfødererede forstærkninger begyndte at ankomme, inklusive brigaden af ​​Brig.General William B. Taliaferro, og unionshæren begyndte modvilligt at trække sig tilbage.Jackson bemærkede til Ewell: "General, den, der ikke ser Guds hånd i dette, er blind, sir, blind."Jacksons fremdrift havde forrådt ham til at angribe, før hans tropper var tilstrækkeligt samlet, hvilket blev vanskeliggjort af de utilstrækkelige midler til at krydse floden.Slaget ved Port Republic var blevet dårligt styret af Jackson og var det mest skadelige for de konfødererede med hensyn til tab – 816 mod en styrke, der var halvt så stor (omkring 6.000 til 3.500).Unionens ofre var 1.002, hvor en høj procentdel repræsenterede fanger.Efter de dobbelte nederlag ved Cross Keys og Port Republic, trak unionshærerne sig tilbage, hvilket efterlod Jackson i kontrol over den øvre og midterste Shenandoah Valley og befriede sin hær for at forstærke Robert E. Lee før Richmond i Seven Days Battles.