Na počátku 21. století čelil Singapur několika významným výzvám, zejména vypuknutí SARS v roce 2003 a rostoucí hrozbě terorismu.V roce 2001 bylo zmařeno znepokojivé spiknutí zaměřené na ambasády a klíčovou infrastrukturu, což vedlo k zatčení 15 členů Jemaah Islamiyah.Tento incident podnítil zavedení komplexních protiteroristických opatření zaměřených na odhalování, prevenci a zmírňování škod.Současně zůstala ekonomika země relativně stabilní, s průměrným měsíčním příjmem domácností v roce 2003 hlášeným na 4 870 SGD.V roce 2004 Lee Hsien Loong, nejstarší syn Lee Kuan Yewa, vystoupil na pozici třetího premiéra Singapuru.Pod jeho vedením bylo navrženo a realizováno několik transformačních národních politik.Zejména se v roce 2005 zkrátila délka výcviku v národní službě ze dvou a půl roku na dva. Vláda také zahájila program „Odstraňování byrokracie“, který aktivně hledá zpětnou vazbu od občanů v řadě problémů, od právních rámců až po společenské zájmy.Všeobecné volby v roce 2006 znamenaly významný obrat v singapurské politické scéně, především kvůli bezprecedentnímu vlivu internetu a blogování, které zůstaly neregulované vládou.Ve strategickém kroku těsně před volbami vláda rozdělila peněžní bonus „pokrokového balíčku“ všem dospělým občanům v celkové výši 2,6 miliardy SGD.Navzdory velké účasti na opozičních shromážděních si vládnoucí Strana lidové akce (PAP) udržela svou pevnost, zajistila si 82 ​​z 84 křesel a získala 66 % hlasů.Vztah Singapuru s Malajsií po získání nezávislosti byl spletitý, často charakterizovaný neshodami, ale podtrženými vzájemnou důvěrou.Jako členové ASEAN oba národy uznávají své společné regionální zájmy.Tato vzájemná závislost je dále zvýrazněna závislostí Singapuru na Malajsii, pokud jde o významnou část jeho dodávek vody.Zatímco obě země se příležitostně zapojily do verbálních zápasů kvůli jejich odlišným post-nezávislým trajektoriím, naštěstí se vyhnuly vážným konfliktům nebo nepřátelství.