V 90. letech 20. století pokračoval myanmarský vojenský režim ve výkonu kontroly, přestože Národní liga pro demokracii (NLD) vyhrála v roce 1990 vícestranné volby. Předsedové NLD Tin Oo a Aung San Suu Kyi byli drženi v domácím vězení a armáda čelila rostoucímu mezinárodnímu tlaku po Suu. Kyi získal Nobelovu cenu za mír v roce 1991. Režim nahradil Saw Maunga generálem Than Shwe v roce 1992 a zmírnil některá omezení, ale zachoval si moc, včetně pozastavení pokusů o vypracování nové ústavy.V průběhu desetiletí musel režim řešit různé etnické povstání.Významné dohody o příměří byly vyjednány s několika kmenovými skupinami, ačkoli trvalý mír s etnickou skupinou Karenů zůstal nepolapitelný.Tlak USA navíc vedl v roce 1995 k dohodě s opiovým válečníkem Khunem Sa. Navzdory těmto výzvám došlo k pokusům o modernizaci vojenského režimu, včetně změny názvu na Státní radu pro mír a rozvoj (SPDC) v roce 1997 a přesun hlavní město z Yangonu do Naypyidaw v roce 2005.Vláda v roce 2003 oznámila sedmikrokovou „cestovní mapu k demokracii“, ale neexistoval žádný harmonogram ani proces ověřování, což vedlo ke skepsi ze strany mezinárodních pozorovatelů.Národní shromáždění se znovu sešlo v roce 2005, aby přepsalo ústavu, ale vyloučilo hlavní prodemokratické skupiny, což vedlo k další kritice.Porušování lidských práv, včetně nucené práce, vedlo Mezinárodní organizaci práce k tomu, aby v roce 2006 usilovala o stíhání členů junty za zločiny proti lidskosti ^[90.]