Михаил II Асен е син на Иван Асен II и Ирина Комнина Дукина.Той наследява своя полубрат Калиман I Асен.Майка му или друг роднина трябва да е управлявал България по време на неговото малолетство.Йоан III Дука Ватац, император на Никея , и Михаил II от Епир нахлуват в България малко след възкачването на Михаил.Ватаци превземат българските крепости по река Вардар;Михаил от Епир завладява Западна Македония.В съюз с Република Рагуза, Михаил II Асен нахлува в Сърбия през 1254 г., но не може да окупира сръбски територии.След смъртта на Ватацес той завладява отново повечето територии, загубени от Никея, но синът и наследник на Ватацес, Теодор II Ласкарис, започва успешна контраофанзива, принуждавайки Михаил да подпише мирен договор.Малко след договора недоволни боляри (благородници) убиват Михаил.