Проучване на азиатската генетика предполага, че първоначалните хора в Източна Азия са дошли от Югоизточна Азия.^[14] Местните групи на полуострова могат да бъдат разделени на три етноса: негритос, сенои и прото-малайци.^[15] Първите жители на Малайския полуостров най-вероятно са били негритос.^[16] Тези мезолитни ловци вероятно са били предците на семангите, етническа група негрито.^[17] Senoi изглежда е съставна група, като приблизително половината от майчините митохондриални ДНК линии се проследяват обратно към предците на Semang и около половината до по-късни миграции на предци от Индокитай.Учените предполагат, че те са потомци на ранни земеделци, говорещи австроазиатски, които донесоха както езика, така и технологията си в южната част на полуострова преди приблизително 4000 години.Те се обединиха и сляха с коренното население.^[18] Прамалайците имат по-разнообразен произход ^[19] и са се заселили в Малайзия до 1000 г. пр. н. е. в резултат на австронезийската експанзия.^[20] Въпреки че показват някои връзки с други обитатели в морска Югоизточна Азия, някои също имат произход в Индокитай около времето на последния ледников максимум преди около 20 000 години.Области, включващи това, което сега е Малайзия, участваха в Maritime Jade Road.Търговската мрежа е съществувала от 3000 години, между 2000 г. пр.н.е. и 1000 г. пр.н.е.^[21]Антрополозите подкрепят идеята, че прото-малайците произхождат от днешния Юнан,Китай .^[22] Това е последвано от раннохолоценско разпръскване през Малайския полуостров в Малайския архипелаг.^[23] Около 300 г. пр. н. е. те са били изтласкани навътре от Deutero-Malays, хора от желязната или бронзовата епоха, произлезли отчасти от Chams от Камбоджа и Виетнам .Първата група на полуострова, използвала метални инструменти, Deutero-Malays са били преките предци на днешните малайзийски малайци и са донесли със себе си съвременни земеделски техники.^[17] Малайците остават политически фрагментирани в целия Малайски архипелаг, въпреки че споделят обща култура и социална структура.^[24]