Ага Мохамед Хан, след като излезе победител от гражданската война след смъртта на последния зандски крал, се съсредоточи върху обединяването и централизирането на Иран.^[54] След Надер Шах и ерата Занд, кавказките територии на Иран са образували различни ханства.Ага Мохамед Хан имаше за цел да включи отново тези региони в Иран, считайки ги за неразделна част от всяка континентална територия.Една от основните му цели беше Грузия, която той смяташе за решаваща за иранския суверенитет.Той настоява грузинският крал Ерекли II да се откаже от своя договор с Русия от 1783 г. и да приеме отново персийския суверенитет, което Ерекли II отказва.В отговор Ага Мохамед Хан започва военна кампания, като успешно възстановява иранския контрол върху различни кавказки територии, включително днешна Армения , Азербайджан , Дагестан и Игдир.Той триумфира в битката при Крцаниси, което води до превземането на Тбилиси и ефективното повторно покоряване на Грузия .^[55]През 1796 г., след завръщането си от успешната си кампания в Грузия и транспортирането на хиляди грузински пленници в Иран, Ага Мохамед Хан официално е коронясан за шах.Управлението му е прекъснато от убийство през 1797 г., докато планира друга експедиция срещу Грузия.След смъртта му Русия се възползва от регионалната нестабилност.През 1799 г. руските сили навлизат в Тбилиси и до 1801 г. те на практика са анексирали Грузия.Това разширяване бележи началото на Руско-персийските войни (1804-1813 и 1826-1828), водещи до евентуалното отстъпване на Източна Грузия, Дагестан, Армения и Азербайджан на Русия, както е предвидено в договорите от Гюлистан и Туркменчай.Така териториите на север от река Арас, включително съвременен Азербайджан, източна Грузия, Дагестан и Армения, остават част от Иран до окупацията им от Русия през 19-ти век.^[56]След Руско-персийските войни и официалната загуба на огромни територии в Кавказ настъпват значителни демографски промени.Войните от 1804–1814 и 1826–1828 доведоха до големи миграции, известни като кавказки мухаджири, към континентален Иран.Това движение включва различни етнически групи като айруми, карапапаци, черкези, шиитски лезгини и други закавказки мюсюлмани.^[57] След битката при Ганджа през 1804 г. много айруми и карапапаци са преселени в Тебриз, Иран.По време на войната от 1804–1813 г. и по-късно по време на конфликта от 1826–1828 г. повече от тези групи от новозавладените руски територии мигрират в Солдуз в днешната провинция Западен Азербайджан, Иран.^[58] Руските военни действия и проблемите с управлението в Кавказ карат голям брой мюсюлмани и някои грузински християни в изгнание в Иран.^[59]От 1864 г. до началото на 20-ти век последваха нови изгонвания и доброволни миграции след руската победа в Кавказката война.Това доведе до допълнителни движения на кавказки мюсюлмани, включително азербайджанци, други транскавказки мюсюлмани и севернокавказки групи като черкези, шиитски лезгини и лаки, към Иран и Турция.^[57] Много от тези мигранти изиграха решаваща роля в историята на Иран, образувайки значителна част от Персийската казашка бригада, създадена в края на 19 век.^[60]Договорът от Туркменчай през 1828 г. също улеснява преселването на арменци от Иран в новите територии, контролирани от Русия.^[61] В исторически план арменците са били мнозинство в Източна Армения, но са станали малцинство след кампаниите на Тимур и последвалото ислямско господство.^[62] Руското нахлуване в Иран допълнително променя етническия състав, което води до арменско мнозинство в Източна Армения до 1832 г. Тази демографска промяна се затвърждава допълнително след Кримската война и Руско-турската война от 1877–1878 г.^[63]През този период Иран преживя засилен дипломатически ангажимент на Запада при Фатх Али Шах.Неговият внук Мохамед Шах Каджар, повлиян от Русия, неуспешно се опитва да превземе Херат.Насер ал-Дин Шах Каджар, наследил Мохамад Шах, беше по-успешен владетел, основавайки първата модерна болница в Иран.^[64]Големият персийски глад от 1870–1871 г. е катастрофално събитие, което води до смъртта на приблизително два милиона души.^[65] Този период бележи значителен преход в персийската история, водещ до Персийската конституционна революция срещу шаха в края на 19-ти и началото на 20-ти век.Въпреки предизвикателствата, шахът се съгласи с ограничена конституция през 1906 г., трансформирайки Персия в конституционна монархия и довеждайки до свикването на първия Меджлис (парламент) на 7 октомври 1906 г.Откриването на петрол през 1908 г. в Хузестан от британците засилва чуждестранните интереси в Персия, особено от страна на Британската империя (свързана с Уилям Нокс Д'Арси и Англо-иранската петролна компания, сега BP).Този период е белязан и от геополитическото съперничество между Обединеното кралство и Русия за Персия, известно като Голямата игра.Англо-руската конвенция от 1907 г. разделя Персия на сфери на влияние, подкопавайки нейния национален суверенитет.По време на Първата световна война Персия е окупирана от британски, османски и руски сили, но остава до голяма степен неутрална.След Първата световна война и Руската революция Великобритания се опитва да установи протекторат над Персия, което в крайна сметка се проваля.Нестабилността в Персия, подчертана от конституционалисткото движение на Гилан и отслабването на правителството на Каджар, проправи пътя за възхода на Реза Хан, по-късно Реза Шах Пахлави, и установяването на династията Пахлави през 1925 г. Основен военен преврат от 1921 г., воден от Реза Хан от Персийската казашка бригада и Сейед Зия'еддин Табатабай, първоначално имаше за цел да контролира правителствените служители, а не директно да свали монархията на Каджар.^[66] Влиянието на Реза Хан нараства и до 1925 г., след като е бил министър-председател, той става първият шах от династията Пахлави.