1947-ci ildə Pakistan ilk baş nazir Liaquat Əli Xan və Baş Qubernator və Parlamentin sədri Məhəmməd Əli Cinna ilə yeni bir dövlət kimi meydana çıxdı.Lord Mountbattenin həm Hindistan , həm də Pakistan üçün general-qubernator olmaq təklifini rədd edən Cinnah 1948-ci ildə ölənə qədər ölkəyə rəhbərlik etdi. Onun rəhbərliyi altında Pakistan İslam dövləti olmaq yolunda addımlar atdı, xüsusən də Baş Nazirin Məqsədlər Qətnaməsi ilə. Xan, 1949-cu ildə Allahın hökmranlığını vurğulayır.Məqsədlər qətnaməsi bütün kainat üzərində hökmranlığın Uca Allaha məxsus olduğunu bəyan etdi.^[5]Pakistanın ilk illərində Hindistandan, xüsusən də ilk paytaxt ^[6] olan Karaçiyə əhəmiyyətli miqrasiya müşahidə edildi.Pakistanın maliyyə infrastrukturunu gücləndirmək üçün onun maliyyə naziri Viktor Turner ölkənin ilk pul siyasətini həyata keçirdi.Buraya Dövlət Bankı, Federal Statistika Bürosu və Federal Gəlirlər Şurası kimi ölkənin maliyyə, vergi və gəlirlərin toplanması sahəsində imkanlarını artırmaq məqsədi daşıyan əsas qurumların yaradılması daxildir.^[7] Bununla belə, Pakistan Hindistanla ciddi problemlərlə üzləşdi.1948-ci ilin aprelində Hindistan Pəncabda iki kanalın tikintisindən Pakistana su təchizatını kəsdi və bu, iki ölkə arasında gərginliyi daha da artırdı.Bundan əlavə, Hindistan əvvəlcə Pakistanın Birləşmiş Hindistandakı aktiv və vəsaitlərinin payını saxladı.Bu aktivlər nəhayət Mahatma Qandinin təzyiqi ilə sərbəst buraxıldı.^[8] 1949-cu ildə Pakistan-Əfqanıstan sərhədi üzərində qonşu Əfqanıstanla və Kəşmirdə Nəzarət Xətti üzərində Hindistanla ərazi problemləri yarandı.^[9]Ölkə həmçinin beynəlxalq səviyyədə tanınmağa çalışdı, bunu ilk tanıyan İran oldu, lakin Sovet İttifaqı və İsrailin ilkin istəksizliyi ilə üzləşdi.Pakistan müsəlman ölkələrini birləşdirməyi qarşısına məqsəd qoyaraq müsəlman dünyasında fəal şəkildə liderlik edirdi.Lakin bu ambisiya beynəlxalq aləmdə və bəzi ərəb xalqları arasında skeptisizmlə üzləşdi.Pakistan da müsəlman dünyasında müxtəlif müstəqillik hərəkatlarını dəstəkləyib.Ölkə daxilində dil siyasəti mübahisəli məsələyə çevrildi, Cinnah Urdu dilini dövlət dili elan etdi və bu, Şərqi Benqaliyada gərginliyə səbəb oldu.1948-ci ildə Cinnahın ölümündən sonra Ser Khawaja Nazimuddin Pakistanın formalaşma illərində dövlət quruculuğu səylərini davam etdirərək Baş Qubernator oldu.