Histiaeus Miletin süqutunu eşidəndə, görünür, özünü Persiyaya qarşı müqavimətin lideri təyin etdi.Lezbiyen ordusu ilə Bizansdan yola düşərək, Sakız adasına üzdü.Çanlılar onu qəbul etməkdən imtina etdilər, buna görə də o, Çian donanmasının qalıqlarına hücum edərək məhv etdi.Dənizdəki iki məğlubiyyətdən şikəst olan Chians daha sonra Histiaeusun rəhbərliyinə razı oldu.Histiaeus indi İoniyalıların və Aeoliyalıların böyük bir qüvvəsini topladı və Tasosu mühasirəyə aldı.Lakin o, Fars donanmasının İoniyanın qalan hissəsinə hücum etmək üçün Miletdən yola düşdüyü xəbərini aldı və tez bir zamanda Lesbosa qayıtdı.Ordusunu qidalandırmaq üçün Atarneus və Myus yaxınlığında materikə yem axtarış ekspedisiyalarına rəhbərlik etdi.Harpagusun rəhbərliyi altında böyük bir fars qüvvəsi ərazidə idi və nəhayət, Malene yaxınlığında bir yem axtarış ekspedisiyasının qarşısını aldı.Sonrakı döyüş çətin keçdi, lakin müvəffəqiyyətli fars süvari hücumu ilə Yunan xəttini yönləndirdi.Histiaeus özü Farslara təslim oldu və Dariusun bağışlanması üçün özünü danışa biləcəyini düşündü.Bununla belə, onun yerinə Artafernsə aparıldı, o, Histiaeusun keçmiş xəyanətindən tam xəbərdar olub, onu dirəyə sancdı və sonra da mumiyalanmış başını Dara göndərdi.Fars donanması və ordusu üsyanın son közünü nəhayət möhürləmək üçün eramızdan əvvəl 493-cü ildə yola düşməzdən əvvəl Miletdə qışladı.Onlar Saqqız, Lesbos və Tenedos adalarına hücum edərək onları ələ keçirdilər.Hər birində onlar qoşunlardan ibarət “insan şəbəkəsi” yaratdılar və gizlənən üsyançıları silmək üçün bütün adanı süpürdülər.Daha sonra materikə köçdülər və İoniyanın qalan şəhərlərinin hər birini ələ keçirdilər, eyni şəkildə qalan üsyançıları axtardılar.İoniya şəhərləri, şübhəsiz ki, bundan sonra darmadağın edilsə də, görünür, heç biri Miletin taleyini yaşamayıb.Herodot deyir ki, farslar hər şəhərdən ən yaraşıqlı oğlanları seçib axtalayır, ən gözəl qızları seçib şahın hərəminə göndərir, sonra isə şəhərlərin məbədlərini yandırırdılar.Bu, mümkün olsa da, doğru olsa da, Herodot dağıntının miqyasını da şişirdir. Bir neçə il ərzində şəhərlər az-çox normal vəziyyətə düşdü və onlar Yunanıstana ikinci fars işğalı üçün böyük bir donanma təchiz edə bildilər, sadəcə 13. illər sonra.Fars ordusu daha sonra Propontisin Asiya tərəfindəki yaşayış məntəqələrini yenidən fəth etdi, fars donanması isə hər bir yaşayış məntəqəsini növbə ilə götürərək Hellespontun Avropa sahillərinə doğru irəlilədi.Bütün Kiçik Asiyanın indi möhkəm şəkildə Fars hakimiyyətinə qayıtması ilə üsyan nəhayət başa çatdı.