Die Franse ekspedisie na Egipte , oënskynlik om die Ottomaanse Porte te ondersteun en dieMamluks te onderdruk, is gelei deur Napoleon Bonaparte.Bonaparte se proklamasie in Alexandrië het gelykheid, meriete en respek vir Islam beklemtoon, in teenstelling met die Mamluks se veronderstelde gebrek aan hierdie eienskappe.Hy het oop toegang aan alle Egiptenare belowe vir administratiewe poste en het voorgestel dat pouslike gesag omvergewerp word om Franse aanhang aan Islam te demonstreer.^[102]Die Egiptenare was egter skepties oor Franse bedoelings.Na die Franse oorwinning in die Slag van Embabeh (Slag van die Piramides), waar Murad Bey en Ibrahim Bey se magte verslaan is, is 'n munisipale raad in Kaïro gevorm wat sjeiks, Mamluks en Franse lede insluit, wat hoofsaaklik gedien het om Franse dekrete af te dwing.^[102]Franse onoorwinlikheid is bevraagteken ná hul vloot se nederlaag in die Slag van die Nyl en mislukking in Bo-Egipte.Spanning het toegeneem met die instelling van 'n huisbelasting, wat gelei het tot 'n opstand in Kaïro in Oktober 1798. Franse Generaal Dupuy is vermoor, maar Bonaparte en Generaal Kléber het die opstand vinnig onderdruk.Die Franse gebruik van Al-Azhar-moskee as 'n stal het diep aanstoot veroorsaak.^[102]Bonaparte se Siriese ekspedisie in 1799 het Franse beheer in Egipte tydelik verswak.Met sy terugkeer het hy 'n gesamentlike aanval deur Murad Bey en Ibrahim Bey verslaan, en later 'n Turkse leër by Aboukir verpletter.Bonaparte het toe Egipte verlaat en Kléber as sy opvolger aangestel.^[102] Kléber het 'n bedenklike situasie in die gesig gestaar.Nadat aanvanklike ooreenkomste vir Franse ontruiming deur die Britte geblokkeer is, het Kaïro onluste beleef, wat Kléber onderdruk het.Hy het met Murad Bey onderhandel en aan hom beheer oor Bo-Egipte gegee, maar Kléber is in Junie 1800 vermoor ^{[. 102]}Generaal Jacques-Francois Menou het Kléber opgevolg en probeer om Moslem-guns te wen, maar Egiptenare vervreem deur 'n Franse protektoraat te verklaar.In 1801 het Engelse en Turkse magte by Abu Qir geland, wat tot Franse nederlae gelei het.Generaal Belliard het Kaïro in Mei oorgegee, en Menou het in Augustus in Alexandrië kapituleer, wat die Franse besetting beëindig het.^[102] Die blywende nalatenskap van die Franse besetting was die "Description de l'Egypte", 'n gedetailleerde studie van Egipte deur Franse geleerdes, wat aansienlik bygedra het tot die veld van Egiptologie.^[102]