Konfrontasi nomi bilan ham tanilgan Indoneziya-Malayziya qarama-qarshiligi 1963 yildan 1966 yilgacha bo'lgan qurolli to'qnashuv bo'lib, Indoneziyaning Malayziya federatsiyasi, Singapur va Shimoliy Borneo va Saravakdagi Britaniya mustamlakalarini birlashtirgan Malayziyaning tashkil topishiga qarshiligidan kelib chiqqan.Mojaro Indoneziyaning Gollandiya Yangi Gvineyasiga qarshi oldingi qarama-qarshiliklari va Bruney qo'zg'olonini qo'llab-quvvatlaganligidan kelib chiqqan.Malayziya Buyuk Britaniya , Avstraliya va Yangi Zelandiyadan harbiy yordam olgan bo'lsa, Indoneziya SSSR va Xitoydan bilvosita yordamga ega bo'lib, bu Osiyodagi Sovuq urushning bobiga aylandi.Mojaroning asosiy qismi Indoneziya va Sharqiy Malayziya oʻrtasidagi Borneodagi chegarada sodir boʻlgan.Zich o'rmon erlari har ikki tomonning keng ko'lamli piyoda patrullarini o'tkazishiga olib keldi, janglar odatda kichik hajmdagi operatsiyalarni o'z ichiga oldi.Indoneziya Malayziyani buzish uchun Sabah va Saravakdagi etnik va diniy xilma-xillikdan foydalanishga harakat qildi.Ikkala xalq ham engil piyoda va havo transportiga tayangan, daryolar harakatlanish va infiltratsiya uchun hal qiluvchi ahamiyatga ega edi.Inglizlar, Avstraliya va Yangi Zelandiya kuchlarining davriy yordami bilan birga, mudofaa yukini o'z zimmalariga oldilar.Indoneziyaning infiltratsiya taktikasi vaqt o'tishi bilan rivojlanib, mahalliy ko'ngillilarga tayanishdan ko'proq tuzilgan Indoneziya harbiy qismlariga o'tdi.1964 yilga kelib, inglizlar Indoneziyadagi Kalimantanda "Klaret" operatsiyasi deb nomlangan maxfiy operatsiyalarni boshladilar.O'sha yili Indoneziya o'z hujumlarini kuchaytirdi, hatto G'arbiy Malayziyani ham nishonga oldi, ammo sezilarli muvaffaqiyatga erisha olmadi.Indoneziyada 1965 yilgi davlat to'ntarishidan keyin mojaroning intensivligi pasayib ketdi, buning natijasida Sukarno general Suxarto bilan almashtirildi.Tinchlik muzokaralari 1966 yilda boshlangan va 1966 yil 11 avgustda Indoneziya Malayziyani rasman tan olgan tinchlik bitimi bilan yakunlangan.