Kennedi ma'muriyati Cho'chqalar ko'rfazi bosqinidan keyin Kastroni quvib chiqarish yo'llarini izlashda davom etdi va Kuba hukumatini ag'darishga yashirin tarzda yordam berishning turli usullarini sinab ko'rdi.Kennedi ma'muriyati ostida 1961 yilda ishlab chiqilgan terroristik hujumlar va boshqa beqarorlik operatsiyalari dasturiga katta umidlar bog'langan edi. Xrushchev bu loyiha haqida 1962 yil fevral oyida bilib oldi va bunga javoban Kubada Sovet yadroviy raketalarini o'rnatishga tayyorgarlik ko'rildi.Xavotirga tushgan Kennedi turli reaktsiyalarni ko'rib chiqdi.Oxir oqibat, u Kubada yadroviy raketalarning o'rnatilishiga dengiz blokadasi bilan javob berdi va Sovet Ittifoqiga ultimatum qo'ydi.Xrushchev qarama-qarshilikdan qaytdi va Sovet Ittifoqi Amerikaning Kubaga boshqa bostirib kirmaslik haqidagi va'dasi, shuningdek, Turkiyadan AQSh raketalarini olib tashlash bo'yicha yashirin kelishuv evaziga raketalarni olib tashladi.Keyinchalik Kastro "yadro qurolidan foydalanishga rozi bo'lardim... biz buni baribir yadroviy urushga aylanishini va biz yo'q bo'lib ketamiz, deb qabul qildik", deb tan oldi.Kubadagi raketa inqirozi (1962 yil oktyabr-noyabr) dunyoni har qachongidan ham yadro urushiga yaqinlashtirdi.Inqirozdan so'ng yadroviy qurollanish poygasida yadroviy qurolsizlanish va munosabatlarni yaxshilash bo'yicha birinchi sa'y-harakatlarga olib keldi, garchi Sovuq urush davridagi qurollarni nazorat qilish bo'yicha birinchi kelishuv - Antarktika shartnomasi 1961 yilda kuchga kirgan edi.1964 yilda Xrushchevning Kremldagi hamkasblari uni hokimiyatdan ag'darishga muvaffaq bo'lishdi, ammo tinchgina nafaqaga chiqishga ruxsat berishdi.Qo'pollik va qobiliyatsizlikda ayblangan Jon Lyuis Gaddisning ta'kidlashicha, Xrushchev Sovet qishloq xo'jaligini vayron qilgan, dunyoni yadro urushi yoqasiga olib kelgan va Berlin devorini qurishga ruxsat berganida Xrushchev "xalqaro sharmandalikka" aylangan.