Sa pangkalahatang halalan noong 1993, ang partido ni Benazir Bhutto ay nakakuha ng isang mayorya, na humantong sa kanyang pagbuo ng isang pamahalaan at pagpili ng isang pangulo.Itinalaga niya ang lahat ng apat na chief of staff – Mansurul Haq (Navy), Abbas Khattak (Air Force), Abdul Waheed (Army), at Farooq Feroze Khan (Joint Chiefs).Ang matatag na diskarte ni Bhutto sa katatagan ng pulitika at ang kanyang mapilit na retorika ay nakakuha sa kanya ng palayaw na "Iron Lady" mula sa mga kalaban.Sinuportahan niya ang panlipunang demokrasya at pambansang pagmamalaki, patuloy na nasyonalisasyon ng ekonomiya at sentralisasyon sa ilalim ng Ikawalong Limang Taon na Plano upang labanan ang stagflation.Ang kanyang patakarang panlabas ay naghangad na balansehin ang mga relasyon sa Iran , Estados Unidos , European Union, at mga sosyalistang estado.Sa panahon ng panunungkulan ni Bhutto, ang ahensya ng paniktik ng Pakistan, ang Inter-Services Intelligence (ISI), ay aktibong kasangkot sa pagsuporta sa mga kilusang Muslim sa buong mundo.Kabilang dito ang pagsalungat sa embargo ng armas ng UN upang tulungan ang mga Muslim na Bosnian, ^[22] paglahok sa Xinjiang, Pilipinas , at Gitnang Asya, ^[23] at pagkilala sa pamahalaang Taliban sa Afghanistan .Napanatili din ni Bhutto ang panggigipit sa India hinggil sa programang nuklear nito at isulong ang sariling kakayahan ng nuklear at misayl ng Pakistan, kabilang ang pag-secure ng teknolohiya ng Air-independent na propulsion mula sa France.Sa kultura, ang mga patakaran ni Bhutto ay nag-udyok sa paglago sa industriya ng musikang rock at pop at pinasigla ang industriya ng pelikula gamit ang bagong talento.Ipinagbawal niya ang Indian media sa Pakistan habang nagpo-promote ng lokal na telebisyon, mga drama, pelikula, at musika.Parehong nagbigay sina Bhutto at Sharif ng malaking pederal na suporta para sa edukasyon sa agham at pananaliksik dahil sa mga pampublikong alalahanin tungkol sa mga kahinaan ng sistema ng edukasyon.Gayunpaman, ang katanyagan ni Bhutto ay tumanggi kasunod ng kontrobersyal na pagkamatay ng kanyang kapatid na si Murtaza Bhutto, na may mga hinala sa kanyang pagkakasangkot, kahit na hindi napatunayan.Noong 1996, pitong linggo lamang pagkatapos ng kamatayan ni Murtaza, ang gobyerno ni Bhutto ay tinanggal ng pangulo na kanyang itinalaga, na bahagyang dahil sa mga kaso na may kaugnayan sa pagkamatay ni Murtaza Bhutto.