Noong Ikalawang Digmaang Pandaigdig , sinakopng Italya sa ilalim ni Benito Mussolini ang Montenegro noong 1941 at isinama sa Kaharian ng Italya ang lugar ng Kotor (Cattaro), kung saan mayroong maliit na populasyon na nagsasalita ng Venetian.Ang papet na Kaharian ng Montenegro ay nilikha sa ilalim ng pasistang kontrol habang si Krsto Zrnov Popović ay bumalik mula sa kanyang pagkatapon sa Roma noong 1941 upang subukang pamunuan ang Zelenaši ("Berde" na partido), na sumuporta sa muling pagbabalik ng monarkiya ng Montenegrin.Ang milisya na ito ay tinawag na Lovćen Brigade.Ang Montenegro ay sinalanta ng isang kakila-kilabot na digmaang gerilya, pangunahin nang palitan ng Nazi Germany ang mga talunang Italyano noong Setyembre 1943.Noong Ikalawang Digmaang Pandaigdig, gaya ng nangyari sa maraming iba pang bahagi ng Yugoslavia, ang Montenegro ay nasangkot sa ilang uri ng digmaang sibil.Bukod sa Montenegrin Greens, ang dalawang pangunahing paksyon ay ang Chetnik Yugoslav army, na nanumpa ng katapatan sa gobyerno sa pagkakatapon at binubuo pangunahin ng mga Montenegrin na nagdeklara ng kanilang sarili bilang Serbs (marami sa mga miyembro nito ay Montenegrin Whites) at Yugoslav Partisans, na ang layunin ay ang paglikha ng isang Sosyalistang Yugoslavia pagkatapos ng digmaan.Dahil ang dalawang paksyon ay nagbahagi ng ilang pagkakatulad sa kanilang mga layunin, lalo na ang mga nauugnay sa isang pinag-isang Yugoslavia at paglaban sa anti-Axis, ang dalawang panig ay nagsanib-kamay at noong 1941 nagsimula ang pag-aalsa noong ika-13 ng Hulyo, ang unang organisadong pag-aalsa sa sinasakop na Europa.Naganap ito dalawang buwan lamang matapos sumuko ang Yugoslavia, at pinalaya ang karamihan sa teritoryo ng Montenegrin, ngunit hindi nabawi ng mga rebelde ang kontrol sa mga pangunahing bayan at lungsod.Matapos ang mga nabigong pagtatangka na palayain ang mga bayan ng Pljevlja at Kolasin, ang mga Italyano, na pinalakas ng mga Aleman, ay muling nakuha ang lahat ng mga naghihimagsik na teritoryo.Sa antas ng pamumuno, ang mga hindi pagkakasundo hinggil sa patakaran ng estado (Centralist monarchy vs. Federal Socialist republic) ay humantong sa isang split sa pagitan ng dalawang panig;sila ay naging mga kaaway mula noon.Patuloy, ang parehong paksyon ay nagsisikap na makakuha ng suporta sa populasyon.Gayunpaman, sa kalaunan ang mga Chetnik sa Montenegro ay nawalan ng suporta sa populasyon, tulad ng iba pang paksyon ng Chetnik sa loob ng Yugoslavia.Ang de facto na pinuno ng mga Chetnik sa Montenegro, si Pavle Djurisic, kasama ang iba pang mga kilalang tao ng kilusan tulad nina Dusan Arsovic at Đorđe Lašić, ay pinanagutan para sa mga masaker sa populasyon ng Muslim sa silangang Bosnia at Sandzak noong 1944. Ang kanilang ideolohiya ng isang homogenous na Serbia sa loob ng Yugoslavia ay napatunayang isang malaking balakid sa pangangalap ng mga liberal, minorya, at Montenegrin na itinuring ang Montenegro bilang isang bansang may sariling pagkakakilanlan.Ang mga kadahilanang ito, bilang karagdagan sa katotohanan na ang ilang mga Chetnik ay nakikipag-usap sa Axis, ay humantong sa pagkawala ng suporta ng hukbong Chetnik Yugoslav sa mga Allies noong 1943. Sa parehong taon, ang Italya, na hanggang noon ay namamahala sa sinasakop na sona, ay sumuko. at pinalitan ng Alemanya, at nagpatuloy ang labanan.Ang Podgorica ay pinalaya ng mga sosyalistang Partisan noong 19 Disyembre 1944, at ang digmaan ng pagpapalaya ay naipanalo.Kinilala ni Josip Broz Tito ang malaking kontribusyon ng Montenegro sa digmaan laban sa mga kapangyarihan ng Axis sa pamamagitan ng pagtatatag nito bilang isa sa anim na republika ng Yugoslavia.