Den tredje generalen med ansvar for å bekjempe opprørerne var Alexius Branas, som på sin side gjorde opprør og vendte seg mot Konstantinopel.Isaac beseiret ham ved hjelp av en annen svoger, Conrad av Montferrat, men denne sivile striden hadde avledet oppmerksomheten fra opprørerne og Isaac var i stand til å sende ut en ny hær først i september 1187. Bysantinene skaffet seg noen få mindreårige seire før vinteren, men opprørerne, hjulpet av Cumans og brukte fjelltaktikkene deres, hadde fortsatt fordelen.Våren 1187 angrep Isaac festningen Lovech, men klarte ikke å fange den etter en tre måneder lang beleiring.Landene mellom Haemus Mons og Donau gikk nå tapt for det bysantinske riket, noe som førte til inngåelsen av en våpenhvile, og dermed de facto anerkjennelse av Asen- og Peters herredømme over territoriet, noe som førte til opprettelsen av det andre bulgarske riket.Keiserens eneste trøst var å holde, som gisler, Asens kone og en viss John (fremtidige Kaloyan fra Bulgaria), bror til de to nye lederne av den bulgarske staten .