Siamesisk og vietnamesisk dominans forsterket seg i løpet av 1600- og 1700-tallet, noe som resulterte i hyppige forskyvninger av maktsetet ettersom den kongelige autoriteten i Khmer ble redusert til en vasalltilstand.Siam, som ellers kunne ha blitt kurtisert som en alliert mot vietnamesiske inngrep på 1700-tallet, var selv involvert i langvarige konflikter med Burma og i 1767 ble den siamesiske hovedstaden Ayutthaya fullstendig ødelagt.Imidlertid kom Siam seg og hevdet snart sitt herredømme over Kambodsja.Den ungdommelige Khmer-kongen Ang Eng (1779–96) ble installert som monark i Oudong mens Siam annekterte Kambodsjas Battambang- og Siem Reap-provinser.De lokale herskerne ble vasaller under direkte siamesisk styre.^[72]Siam og Vietnam hadde fundamentalt forskjellige holdninger til forholdet til Kambodsja.Siameserne delte en felles religion, mytologi, litteratur og kultur med khmerene, etter å ha adoptert mange religiøse og kulturelle praksiser.^[73] De thailandske Chakri-kongene fulgte Chakravatin-systemet til en ideell universell hersker, som etisk og velvillig hersket over alle hans undersåtter.Vietnameserne vedtok et siviliserende oppdrag, da de så på Khmer-folket som kulturelt underlegne og betraktet Khmer-landene som et legitimt sted for kolonisering av nybyggere fra Vietnam.^[74]En fornyet kamp mellom Siam og Vietnam om kontroll over Kambodsja og Mekong-bassenget på begynnelsen av 1800-tallet resulterte i vietnamesisk dominans over en kambodsjansk vasallkonge.Forsøk på å tvinge kambodsjerne til å adoptere vietnamesiske skikker forårsaket flere opprør mot vietnamesisk styre.Den mest bemerkelsesverdige fant sted fra 1840 til 1841, og spredte seg gjennom store deler av landet.Territoriet til Mekong-deltaet ble en territoriell strid mellom kambodsjanske og vietnamesere.Kambodsja mistet gradvis kontrollen over Mekong-deltaet.