I 1821 fikk Mexico sin uavhengighet fraSpania , først som det første meksikanske riket, deretter som den meksikanske republikken.Alta California ble et territorium i stedet for en full stat.Den territorielle hovedstaden forble i Monterey, California, med en guvernør som utøvende tjenestemann.Mexico, etter uavhengighet, var ustabilt med rundt 40 regjeringsskifter, i de 27 årene før 1848 - en gjennomsnittlig regjeringsvarighet var 7,9 måneder.I Alta California arvet Mexico en stor, tynt bosatt, fattig, bakevjeprovins som betalte lite eller ingen netto skatteinntekter til den meksikanske staten.I tillegg hadde Alta California et synkende misjonssystem ettersom den misjonsindianske befolkningen i Alta California fortsatte å raskt avta.Antall nybyggere i Alta California, alltid en minoritet av den totale befolkningen, økte sakte med flere fødsler enn dødsfall i Californio-befolkningen i California.Etter stengingen av de Anza-stien over Colorado-elven i 1781 var immigrasjonen fra Mexico nesten alt med skip.California fortsatte å være et tynt befolket og isolert territorium.Nybyggerne, og deres etterkommere (som ble kjent som Californios), var ivrige etter å handle for nye varer, ferdigvarer, luksusvarer og andre varer.Den meksikanske regjeringen avskaffet politikken for ingen handel med utenlandske skip, og snart ble det gjennomført regelmessige handelsreiser.I tillegg ble en rekke europeere og amerikanere naturaliserte meksikanske statsborgere og bosatte seg tidlig i California.Noen av disse ble rancheros og handelsmenn i løpet av den meksikanske perioden, for eksempel Abel Stearns.Storfeskinn og talg, sammen med sjøpattedyrpels og andre varer, ga de nødvendige handelsartikler for gjensidig fordelaktig handel.De første amerikanske , engelske og russiske handelsskipene dukket først opp i California noen år før 1820. Fra 1825 til 1848 økte gjennomsnittlig antall skip som reiste til California til rundt 25 skip per år – en stor økning fra gjennomsnittet på 2,5 skip pr. år fra 1769 til 1824. Hovedinnfartshavnen for handelsformål var Monterey, hvor tollavgifter på opptil 100 % (også kalt tariffer) ble brukt.