Det er tydelig at de demoraliserte og slitne grekerne ikke var noen match for perserne , og ble fullstendig forkastet i slaget som fulgte ved Efesos.Mange ble drept, inkludert den eretriske generalen Eualcides.Jonerne som slapp unna slaget tok seg til sine egne byer, mens de gjenværende athenerne og eretrerne klarte å vende tilbake til skipene sine og seilte tilbake til Hellas.Athenerne avsluttet nå alliansen med jonerne, siden perserne hadde vist seg å være alt annet enn det lette byttet som Aristagoras hadde beskrevet.Imidlertid forble jonierne forpliktet til sitt opprør, og perserne så ikke ut til å følge opp seieren i Efesos.Antagelig var disse ad hoc-styrkene ikke utstyrt for å beleire noen av byene.Til tross for nederlaget ved Efesos, spredte opprøret seg faktisk videre.Ionerne sendte menn til Hellespont og Propontis og fanget Bysants og de andre nærliggende byene.De overtalte også karerne til å bli med i opprøret.Videre, etter at opprøret ble spredt, gjorde kongedømmene på Kypros også opprør mot persisk styre uten noen ekstern overtalelse.Dermed hadde ikke slaget ved Efesos noen stor effekt på opprøret.