ოკუპაციის დროს გაიზარდა ეთნიკური დაძაბულობა და გაიზარდა ნაციონალიზმი.^[82] ბრიტანეთი გაკოტრდა და ახალი ლეიბორისტული მთავრობა სურდა თავისი ძალების გაყვანა აღმოსავლეთიდან.მაგრამ მალაიელთა უმეტესობა უფრო მეტად ზრუნავდა MCP-ისგან თავის დაცვაზე, ვიდრე ბრიტანელებისგან დამოუკიდებლობის მოთხოვნით.1944 წელს ბრიტანელებმა შეადგინეს გეგმები მალაიის კავშირისთვის, რომელიც გადააქცევდა ფედერაციულ და არაფედერაციულ მალაის შტატებს, პლუს პენანგს და მალაკას (მაგრამ არა სინგაპურს ), ერთი გვირგვინის კოლონიად, დამოუკიდებლობისკენ.ეს ნაბიჯი, რომელიც მიზნად ისახავდა საბოლოო დამოუკიდებლობისკენ, შეხვდა მალაიელების მნიშვნელოვან წინააღმდეგობას, უპირველეს ყოვლისა, ეთნიკური ჩინელებისა და სხვა უმცირესობებისთვის შემოთავაზებული თანაბარი მოქალაქეობის გამო.ბრიტანელები ამ ჯგუფებს ომის დროს უფრო ლოიალურად აღიქვამდნენ, ვიდრე მალაიელები.ამ წინააღმდეგობამ გამოიწვია მალაიის კავშირის დაშლა 1948 წელს, რამაც ადგილი დაუთმო მალაიას ფედერაციას, რომელიც ინარჩუნებდა მალაიის სახელმწიფო მმართველების ავტონომიას ბრიტანეთის მფარველობის ქვეშ.ამ პოლიტიკური ცვლილებების პარალელურად, მალაიას კომუნისტური პარტია (MCP), რომელსაც ძირითადად ეთნიკური ჩინელები უჭერდნენ მხარს, იმპულსს იძენდა.MCP, თავდაპირველად ლეგალური პარტია, გადავიდა პარტიზანული ომისკენ, ბრიტანელების მალაიადან განდევნის მისწრაფებით.1948 წლის ივლისისთვის ბრიტანეთის მთავრობამ გამოაცხადა საგანგებო მდგომარეობა, რამაც აიძულა MCP უკან დაიხია ჯუნგლებში და ჩამოაყალიბა მალაიის სახალხო განმათავისუფლებელი არმია.ამ კონფლიქტის ძირეული მიზეზები მერყეობდა საკონსტიტუციო ცვლილებებიდან, რამაც ეთნიკური ჩინელების მარგინალიზება მოახდინა, გლეხების გადასახლებამდე პლანტაციების განვითარებისთვის.თუმცა, MCP-მ მინიმალური მხარდაჭერა მოიპოვა გლობალური კომუნისტური ძალებისგან.მალაიის საგანგებო ვითარებაში, რომელიც გაგრძელდა 1948 წლიდან 1960 წლამდე, ბრიტანელებმა გამოიყენეს თანამედროვე კონტრ-აჯანყების ტაქტიკა, რომელსაც ხელმძღვანელობდა გენერალ-ლეიტენანტი სერ ჯერალდ ტემპლერი, MCP-ის წინააღმდეგ.მიუხედავად იმისა, რომ კონფლიქტმა იხილა თავისი წილი სისასტიკით, როგორიცაა ბატანგ კალი ხოცვა-ჟლეტა, ბრიტანეთის სტრატეგიამ MCP-ის იზოლირება მისი მხარდაჭერის ბაზიდან, ეკონომიკურ და პოლიტიკურ დათმობებთან ერთად, თანდათან ასუსტებდა მეამბოხეებს.1950-იანი წლების შუა პერიოდისთვის, ტალღა გადატრიალდა MCP-ის წინააღმდეგ, რაც საფუძველი ჩაუყარა ფედერაციის დამოუკიდებლობას თანამეგობრობის ფარგლებში 1957 წლის 31 აგვისტოს, ტუნკუ აბდულ რაჰმანთან ერთად მისი ინაუგურაციის პრემიერ მინისტრი.