მე-16 საუკუნის დასაწყისში, 1517 წელს ეგვიპტის ოსმალთა დაპყრობის შემდეგ, სულთანმა სელიმ I-მა დანიშნა იუნუს ფაშა ეგვიპტის გუბერნატორად, მაგრამ ის მალევე შეცვალა ჰაიირ ბეიმ კორუფციის საკითხების გამო.^[97] ამ პერიოდში აღინიშნა ბრძოლა ძალაუფლებისთვის ოსმალეთის წარმომადგენლებსა დამამლუქებს შორის, რომლებმაც მნიშვნელოვანი გავლენა შეინარჩუნეს.მამლუქები შეიყვანეს ადმინისტრაციულ სტრუქტურაში, ეკავათ საკვანძო თანამდებობები ეგვიპტის 12 სანჯაკში.სულთან სულეიმან დიდებულის დროს შეიქმნა დიდი დივანი და მცირე დივანი ფაშას დასახმარებლად, არმიისა და რელიგიური ხელისუფლების წარმომადგენლობით.სელიმმა ეგვიპტის დასაცავად ექვსი პოლკი დააარსა, რომელსაც სულეიმანმა მეშვიდე დაამატა.^[98]ოსმალეთის ადმინისტრაცია ხშირად ცვლიდა ეგვიპტის გუბერნატორს, ხშირად ყოველწლიურად.ერთი გუბერნატორი, ჰაინ აჰმედ ფაშა, ცდილობდა დამოუკიდებლობის დამყარებას, მაგრამ ჩაიშალა და სიკვდილით დასაჯეს.^[98] 1527 წელს ეგვიპტეში ჩატარდა მიწის კვლევა, სადაც მიწა იყოფა ოთხ ტიპად: სულთნის სამფლობელო, ფიფები, სამხედრო მოსავლის მიწა და რელიგიური საძირკვლის მიწები.ეს გამოკითხვა ჩატარდა 1605 წელს. ^[98]მე-17 საუკუნე ეგვიპტეში ხასიათდებოდა სამხედრო ამბოხებითა და კონფლიქტებით, ხშირად ჯარების გამოძალვის მცდელობის გამო.1609 წელს მნიშვნელოვანმა კონფლიქტმა გამოიწვია ყარა მეჰმედ ფაშას ტრიუმფალური შესვლა კაიროში, რასაც მოჰყვა ფინანსური რეფორმები.^[98] ამ დროის განმავლობაში ადგილობრივმა მამლუქმა ბეგებმა მოიპოვეს დომინირება ეგვიპტის ადმინისტრაციაში, ხშირად ეკავათ სამხედრო თანამდებობები და ებრძოდნენ ოსმალების მიერ დანიშნულ გუბერნატორებს.^[99] ეგვიპტის არმია, ძლიერი ადგილობრივი კავშირებით, ხშირად ახდენდა გავლენას გუბერნატორების დანიშვნაზე და ჰქონდა მნიშვნელოვანი კონტროლი ადმინისტრაციაზე.^[100]საუკუნეში ასევე აღინიშნა ორი გავლენიანი ფრაქციის აღზევება ეგვიპტეში: ფაქარი, რომელიც დაკავშირებულია ოსმალეთის კავალერიასთან და ქასიმი, რომელიც დაკავშირებული იყო ადგილობრივ ეგვიპტურ ჯარებთან.ეს ფრაქციები, რომლებიც სიმბოლურად გამოხატულია მათი განსხვავებული ფერებითა და სიმბოლოებით, მნიშვნელოვანი გავლენა იქონიეს ოსმალეთის ეგვიპტის მმართველობასა და პოლიტიკაზე.^[101]