Durante la guerra in Bosnia e in Croazia del 1991-1995, il Montenegro ha partecipato con le sue forze di polizia e militari agli attacchi a Dubrovnik, Croazia e città bosniache insieme alle truppe serbe, atti aggressivi volti ad acquisire più territori con la forza, caratterizzati da un modello coerente di violazioni gravi e sistematiche dei diritti umani.Il generale montenegrino Pavle Strugar è stato condannato per il suo ruolo nel bombardamento di Dubrovnik.I rifugiati bosniaci furono arrestati dalla polizia montenegrina e trasportati nei campi serbi di Foča, dove furono sottoposti a torture sistematiche e giustiziati.Nel maggio 1992, le Nazioni Unite hanno imposto un embargo alla RFY: ciò ha influenzato molti aspetti della vita del paese.Grazie alla sua posizione geografica favorevole (accesso al mare Adriatico e collegamento marittimo con l’Albania attraverso il lago di Scutari), il Montenegro è diventato un centro per l’attività di contrabbando.L'intera produzione industriale montenegrina si era fermata e la principale attività economica della repubblica era diventata il contrabbando di beni di consumo, soprattutto quelli di scarsa disponibilità, come la benzina e le sigarette, i cui prezzi erano saliti alle stelle.Diventò una pratica de facto legalizzata e andò avanti per anni.Nella migliore delle ipotesi, il governo montenegrino ha chiuso un occhio sull’attività illegale, ma soprattutto vi ha preso parte attiva.Il contrabbando ha reso milionari tutti i tipi di individui loschi, compresi alti funzionari governativi.Milo Đukanović continua ad affrontare azioni legali in vari tribunali italiani per il suo ruolo nel diffuso contrabbando durante gli anni '90 e nel fornire rifugio sicuro in Montenegro a diverse figure della mafia italiana che avrebbero preso parte anche loro alla catena di distribuzione del contrabbando.