Alla fine dell'XI secolo, la dinastia Khwarazmiana assunse il controllo sull'Iraq.Questo periodo di dominio secolare turco e del califfato abbaside si concluse con le invasioni mongole nel XIII secolo.^[51] I mongoli, guidati da Gengis Khan, avevano conquistato la Corasmia nel 1221. Tuttavia, l'Iraq conobbe una tregua temporanea a causa della morte di Gengis Khan nel 1227 e delle successive lotte di potere all'interno dell'Impero mongolo.Möngke Khan, dal 1251, riaccese l'espansione mongola e quando il califfo al-Mustasim rifiutò le richieste mongole, Baghdad dovette affrontare un assedio guidato da Hulagu Khan nel 1258.L'assedio di Baghdad, un evento cruciale nelle conquiste mongole, durò 13 giorni dal 29 gennaio al 10 febbraio 1258. Le forze mongole dell'Ilkhanato , insieme ai loro alleati, assediarono, catturarono e infine saccheggiarono Baghdad, all'epoca capitale del califfato abbaside .Questo assedio provocò il massacro della maggior parte degli abitanti della città, potenzialmente centinaia di migliaia.L'entità della distruzione delle biblioteche della città e dei loro preziosi contenuti rimane argomento di dibattito tra gli storici.Le forze mongole giustiziarono Al-Musta'sim e inflissero un grave spopolamento e devastazione a Baghdad.Questo assedio segnò simbolicamente la fine dell'Età dell'Oro islamica, periodo durante il quale i califfi avevano esteso il loro dominio dalla penisola iberica al Sindh.