Dopo un lungo periodo di sicuro dominio romano, dal 320 la Pannonia fu di nuovo in frequenti guerre con i popoli germanici orientali e sarmati a nord e ad est.Sia i Vandali che i Goti marciarono attraverso la provincia, provocando enormi distruzioni.^[6] Dopo la divisione dell'Impero Romano, la Pannonia rimase sotto il dominio dell'Impero Romano d'Occidente, sebbene il distretto di Sirmio fosse in realtà più nella sfera d'influenza dell'Oriente.Man mano che la popolazione latina della provincia fuggiva dalle continue incursioni barbaresche, ^[7] gruppi unni cominciarono a comparire sulle rive del Danubio.Nel 375 d.C., i nomadi Unni iniziarono a invadere l'Europa dalle steppe orientali, istigando la Grande Era delle Migrazioni.Nel 380, gli Unni penetrarono nell'odierna Ungheria e rimasero un fattore importante nella regione fino al V secolo.Le province pannoniche subirono il Periodo Migratorio dal 379 in poi, l'insediamento dell'alleato Goto-Alan-Unno causò ripetute gravi crisi e devastazioni, i contemporanei lo descrissero come uno stato d'assedio, la Pannonia divenne un corridoio di invasione sia a nord che in il Sud.La fuga e l'emigrazione dei romani iniziò dopo due duri decenni nel 401, ciò provocò anche una recessione nella vita laica ed ecclesiastica.Il controllo degli Unni si espanse gradualmente sulla Pannonia a partire dal 410, infine l'Impero Romano ratificò la cessione della Pannonia con trattato nel 433. La fuga e l'emigrazione dei Romani dalla Pannonia continuò senza interruzione fino all'invasione degli Avari.Gli Unni, approfittando della partenza dei Goti, Quadi, et al., Crearono un impero significativo nel 423 con sede in Ungheria.Nel 453 raggiunsero l'apice della loro espansione sotto il noto conquistatore Attila l'Unno.L'impero crollò nel 455, quando gli Unni furono sconfitti dalle vicine tribù germaniche (come Quadi, Gepidi e Sciri).