Jackson ha saputo alle 7 del mattino che i federali si stavano avvicinando alla sua colonna.Senza un'adeguata ricognizione o aspettando che il grosso delle sue forze arrivasse, ordinò alla Brigata Stonewall di Winder di caricare attraverso la nebbia che si diradava.La brigata fu presa tra l'artiglieria sul fianco e le raffiche di fucili sul fronte e si ritirò allo sbando.Si erano imbattuti in due brigate all'avanguardia dell'esercito di Shields, 3.000 uomini sotto Briga.Gen. Erastus B. Tyler.Tentando di districarsi da un potenziale disastro, Jackson si rese conto che il fuoco dell'artiglieria dell'Unione proveniva da uno sperone del Blue Ridge.Jackson e Winder inviarono il 2 ° e il 4 ° reggimento di fanteria della Virginia attraverso il fitto sottobosco su per la collina, dove incontrarono tre reggimenti di fanteria dell'Unione che sostenevano l'artiglieria e furono respinti.Dopo che il suo assalto al Coaling fallì, Jackson ordinò al resto della divisione di Ewell, principalmente alla brigata di Trimble, di attraversare il ponte del North River e bruciarlo dietro di loro, mantenendo gli uomini di Frémont isolati a nord del fiume.Mentre aspettava l'arrivo di queste truppe, Jackson rafforzò la sua linea con la settima fanteria della Louisiana della brigata di Taylor e ordinò a Taylor di fare un altro tentativo contro le batterie dell'Unione.Winder ha percepito che i federali stavano per attaccare, quindi ha ordinato una carica preventiva, ma di fronte a raffiche a bruciapelo e scarsità di munizioni, la Stonewall Brigade è stata sconfitta.A questo punto, Ewell arrivò sul campo di battaglia e ordinò al 44° e 58° reggimento di fanteria della Virginia di colpire il fianco sinistro della linea di battaglia dell'Unione che avanzava.Gli uomini di Tyler si ritirarono, ma si riorganizzarono e guidarono gli uomini di Ewell nella foresta a sud del Coaling.Taylor attaccò tre volte la fanteria e l'artiglieria sul Coaling prima di prevalere, ma avendo raggiunto il loro obiettivo, dovette affrontare una nuova carica di tre reggimenti dell'Ohio.Fu solo l'apparizione a sorpresa delle truppe di Ewell che convinse Tyler a ritirare i suoi uomini.I Confederati iniziarono a bombardare le truppe dell'Unione sulle terre pianeggianti, con lo stesso Ewell che presidiava allegramente uno dei cannoni.Cominciarono ad arrivare altri rinforzi confederati, inclusa la brigata di Briga.Il generale William B. Taliaferro e l'esercito dell'Unione iniziarono a ritirarsi con riluttanza.Jackson fece notare a Ewell: "Generale, chi non vede la mano di Dio in questo è cieco, signore, cieco".L'impetuosità di Jackson lo aveva tradito nell'attaccare prima che le sue truppe fossero sufficientemente ammassate, il che era reso difficile dai mezzi insufficienti per attraversare il fiume.La battaglia di Port Republic era stata gestita male da Jackson e fu la più dannosa per i Confederati in termini di vittime: 816 contro una forza pari alla metà delle sue dimensioni (da circa 6.000 a 3.500).Le vittime sindacali furono 1.002, con un'alta percentuale rappresentata dai prigionieri.Dopo le doppie sconfitte a Cross Keys e Port Republic, gli eserciti dell'Unione si ritirarono, lasciando a Jackson il controllo della Shenandoah Valley superiore e centrale e liberando il suo esercito per rinforzare Robert E. Lee prima di Richmond nelle Battaglie dei Sette Giorni.