Hun Sen dan pemerintahannya telah menyaksikan banyak kontroversi.Hun Sen adalah mantan komandan Khmer Merah yang awalnya dilantik oleh Vietnam dan, setelah Vietnam meninggalkan negaranya, mempertahankan posisi kuatnya dengan kekerasan dan penindasan bila dianggap perlu.^[101] Pada tahun 1997, karena takut akan meningkatnya kekuasaan rekan Perdana Menterinya, Pangeran Norodom Ranariddh, Hun melancarkan kudeta, menggunakan tentara untuk membersihkan Ranariddh dan para pendukungnya.Ranariddh digulingkan dan melarikan diri ke Paris sementara penentang Hun Sen lainnya ditangkap, disiksa dan beberapa di antaranya dieksekusi.^[101]