Orang Yunani pada periode klasik percaya bahwa, di zaman kegelapan setelah runtuhnya peradaban Mycenaean, sejumlah besar orang Yunani melarikan diri dan beremigrasi ke Asia Kecil dan menetap di sana.Para pemukim ini berasal dari tiga kelompok suku: Aeolian, Dorian, dan Ionia.Bangsa Ionia telah menetap di sekitar pantai Lydia dan Caria, mendirikan dua belas kota yang membentuk Ionia.Kota-kota Ionia tetap merdeka sampai ditaklukkan oleh bangsa Lydia di Asia Kecil bagian barat.Pangeran Persia Cyrus memimpin pemberontakan melawan raja Median terakhir Astyages pada tahun 553 SM.Saat berperang melawan bangsa Lydia, Cyrus mengirim pesan kepada bangsa Ionia meminta mereka untuk memberontak melawan pemerintahan Lydia, namun bangsa Ionia menolak melakukannya.Setelah Cyrus menyelesaikan penaklukan Lydia, kota-kota Ionia kini menawarkan diri untuk menjadi rakyatnya dengan ketentuan yang sama seperti yang pernah mereka terima dari Croesus.Cyrus menolak, dengan alasan keengganan orang Ionia untuk membantunya sebelumnya.Bangsa Ionia kemudian bersiap untuk mempertahankan diri, dan Cyrus mengirim jenderal Median Harpagus untuk menaklukkan mereka.Pada tahun-tahun setelah penaklukan mereka, Persia mendapati bangsa Ionia sulit untuk dikuasai.Oleh karena itu, Persia memutuskan untuk mensponsori seorang tiran di setiap kota di Ionia, meskipun hal ini menyeret mereka ke dalam konflik internal di Ionia.Menjelang pecahnya perang Yunani-Persia, kemungkinan besar penduduk Ionia sudah tidak puas dan siap memberontak.