Norman Duke Robert Guiscard dari Apulia bersiap untuk menginvasi Kekaisaran Bizantium pada tahun 1081 dengan dalih mempertahankan suksesi Constantine Doukas, yang telah bertunangan dengan putri Robert, Helena;pada saat yang sama, Seljuk merebut kota Cyzicus.Alexios dipercayakan dengan pasukan besar untuk mengalahkan ancaman Norman tetapi berkonspirasi dengan kerabatnya John Doukas untuk mengambil tahta untuk dirinya sendiri.Alexios memberontak melawan Nikephoros dan dapat dengan cepat mengepung Konstantinopel dan mengepungnya karena kurangnya pasukan pertahanan.Nikeophoros tidak dapat memperoleh dukungan baik dari Turki Seljuk atau Nikephoros Melissenos, saingan tradisionalnya, dan dengan demikian terpaksa bersiap untuk turun tahta.Nikephoros memutuskan bahwa satu-satunya pilihannya adalah turun tahta demi Melissenos, yang berada di dekat Damalis di Anatolia, dan mengirim utusan kepadanya melintasi Bosphorus;namun, utusan ini dicegat oleh George Palaiologos, seorang jenderal Alexios, yang membujuk mereka untuk mendukung Alexios.Alexios dan pasukannya menerobos tembok Konstantinopel pada tanggal 1 April 1081 dan menjarah kota itu;Patriark Cosmas meyakinkan Nikephoros untuk turun tahta ke Alexios daripada memperpanjang perang saudara.Nikephoros kemudian melarikan diri ke Hagia Sophia dan mencari perlindungan di dalamnya.Michael, logothete dari Alexios, kemudian mengawal Nikephoros ke Biara Peribleptus, di mana dia turun tahta dan menjadi seorang biarawan.Dia meninggal akhir tahun itu.