Lee, meskipun kalah jumlah dengan rasio lebih dari dua banding satu, bisa dibilang memenangkan kemenangan terbesarnya dalam perang, kadang-kadang digambarkan sebagai "pertempuran sempurna".^[25] Tapi dia membayar harga yang sangat mahal untuk itu, mengambil lebih banyak korban daripada yang hilang dalam pertempuran sebelumnya, termasuk kekalahan Konfederasi di Pertempuran Antietam .Dengan hanya 60.000 orang yang terlibat, ia menderita 13.303 korban (1.665 tewas, 9.081 luka-luka, 2.018 hilang), ^[34] kehilangan sekitar 22% pasukannya dalam kampanye — orang-orang yang tidak dapat digantikan oleh Konfederasi, dengan tenaga terbatasnya.Sama seriusnya, dia kehilangan komandan lapangannya yang paling agresif, Stonewall Jackson.Penjara.Jenderal Elisha F. Paxton adalah jenderal Konfederasi lainnya yang terbunuh selama pertempuran.Setelah Longstreet bergabung kembali dengan pasukan utama, dia sangat kritis terhadap strategi Lee, mengatakan bahwa pertempuran seperti Chancellorsville menghabiskan lebih banyak orang daripada yang bisa ditanggung oleh Konfederasi.^[26]Hooker, yang memulai kampanye dengan keyakinan bahwa dia memiliki "80 peluang dalam 100 untuk menjadi sukses", kalah dalam pertempuran karena miskomunikasi, ketidakmampuan beberapa jenderal utamanya (terutama Howard dan Stoneman, tetapi juga Sedgwick), tetapi sebagian besar karena keruntuhan. dari kepercayaan dirinya sendiri.Kesalahan Hooker termasuk mengabaikan dorongan ofensifnya pada 1 Mei dan memerintahkan Sickles untuk menyerahkan Hazel Grove dan mundur pada 2 Mei. Dia juga melakukan kesalahan dalam pengaturan kekuatannya;terlepas dari nasihat Abraham Lincoln, "kali ini masukkan semua orangmu," sekitar 40.000 orang dari Tentara Potomac hampir tidak melepaskan tembakan.Union dikejutkan oleh kekalahan tersebut.Presiden Abraham Lincoln dikutip mengatakan, "Ya Tuhan! Tuhanku! Apa yang akan dikatakan negara?"Beberapa jenderal menjadi korban karir.Presiden Lincoln memilih untuk mempertahankan Hooker sebagai komando tentara, tetapi gesekan antara Lincoln, panglima tertinggi Henry W. Halleck, dan Hooker menjadi tidak dapat ditoleransi pada hari-hari awal dari apa yang kemudian dikenal sebagai kampanye Gettysburg dan Lincoln membebaskan Hooker dari komando. 28 Juni, tepat sebelum Pertempuran Gettysburg .Publik Konfederasi memiliki perasaan campur aduk tentang hasilnya, kegembiraan atas kemenangan taktis Lee yang diimbangi dengan hilangnya jenderal yang paling mereka cintai, Stonewall Jackson.Kematian Jackson menyebabkan Lee melakukan reorganisasi Angkatan Darat Virginia Utara yang telah lama dibutuhkan dari dua korps besar menjadi tiga, di bawah James Longstreet, Richard S. Ewell, dan AP Hill.Penugasan baru untuk dua jenderal terakhir menyebabkan beberapa kesulitan komando dalam kampanye Gettysburg yang akan datang, yang dimulai pada bulan Juni.Konsekuensi yang lebih besar bagi Gettysburg, bagaimanapun, adalah keyakinan tertinggi yang diperoleh Lee dari kemenangan besarnya di Chancellorsville, bahwa pasukannya hampir tak terkalahkan dan akan berhasil dalam apa pun yang dia minta.^[27]