Pada bulan Januari 1863, Tentara Potomac, setelah Pertempuran Fredericksburg dan Mud March yang memalukan, menderita karena meningkatnya desersi dan menurunnya moral.Lincoln mencoba kelima kalinya dengan jenderal baru pada tanggal 25 Januari 1863—Mayor.Jenderal Joseph Hooker, seorang pria dengan reputasi garang yang telah bekerja dengan baik dalam komando bawahan sebelumnya.^[56]Hooker memulai reorganisasi angkatan bersenjata yang sangat dibutuhkan, menghapuskan sistem divisi besar Burnside, yang terbukti sulit digunakan;dia juga tidak lagi memiliki cukup perwira senior yang dapat dia percayai untuk memimpin operasi multi-korps.^[57] Ia mengatur kavaleri menjadi korps terpisah di bawah komando Brigjen.Jenderal George Stoneman.Namun ketika ia memusatkan kavaleri menjadi satu organisasi, ia membubarkan batalion artilerinya ke dalam kendali komandan divisi infanteri, menghilangkan pengaruh koordinasi dari kepala artileri angkatan darat, Brigjen.Jenderal Henry J. Hunt.Perubahan yang dilakukannya antara lain perbaikan pola makan sehari-hari tentara, perubahan sanitasi kamp, ​​perbaikan dan akuntabilitas sistem quartermaster, penambahan dan pemantauan juru masak perusahaan, beberapa reformasi rumah sakit, perbaikan sistem cuti, perintah untuk membendung meningkatnya desersi, peningkatan latihan. , dan pelatihan petugas yang lebih kuat.Kedua pasukan saling berhadapan di Fredericksburg selama musim dingin tahun 1862–1863.Kampanye Chancellorsville dimulai ketika Hooker diam-diam memindahkan sebagian besar pasukannya ke tepi kiri Sungai Rappahannock, lalu menyeberanginya pada pagi hari tanggal 27 April 1863. Kavaleri serikat di bawah pimpinan Mayor Jenderal George Stoneman memulai serangan jarak jauh terhadap jalur suplai Lee pada waktu yang hampir bersamaan.Menyeberangi Sungai Rapidan melalui Ford Germanna dan Ely, infanteri Federal terkonsentrasi di dekat Chancellorsville pada tanggal 30 April. Dikombinasikan dengan pasukan Union yang menghadapi Fredericksburg, Hooker merencanakan pengepungan ganda, menyerang Lee dari depan dan belakang.Pada tanggal 1 Mei, Hooker maju dari Chancellorsville menuju Lee, tetapi jenderal Konfederasi membagi pasukannya karena jumlah pasukannya yang lebih banyak, meninggalkan pasukan kecil di Fredericksburg untuk menghalangi Mayor Jenderal John Sedgwick untuk maju, sementara dia menyerang kemajuan Hooker dengan sekitar empat orang. -seperlima pasukannya.Meskipun bawahannya keberatan, Hooker menarik anak buahnya ke garis pertahanan di sekitar Chancellorsville, menyerahkan inisiatif kepada Lee.Pada tanggal 2 Mei, Lee membagi pasukannya lagi, mengirimkan seluruh korps Stonewall Jackson dalam barisan sayap yang mengalahkan Korps Union XI.Pertempuran paling sengit dalam pertempuran tersebut—dan hari paling berdarah kedua dalam Perang Saudara—terjadi pada tanggal 3 Mei ketika Lee melancarkan beberapa serangan terhadap posisi Union di Chancellorsville, yang mengakibatkan kerugian besar di kedua sisi dan mundurnya pasukan utama Hooker.Pada hari yang sama, Sedgwick maju melintasi Sungai Rappahannock, mengalahkan pasukan kecil Konfederasi di Marye's Heights dalam Pertempuran Kedua Fredericksburg, dan kemudian bergerak ke barat.Konfederasi berhasil melakukan tindakan penundaan di Pertempuran Gereja Salem.Pada tanggal 4 Lee memunggungi Hooker dan menyerang Sedgwick, dan membawanya kembali ke Ford Banks, mengepung mereka di tiga sisi.Sedgwick mundur melintasi arungan pada awal tanggal 5 Mei. Lee berbalik untuk menghadapi Hooker yang menarik sisa pasukannya melintasi Ford AS pada malam tanggal 5–6 Mei.Chancellorsville dikenal sebagai "pertempuran sempurna" Lee ^[58] karena keputusannya yang berisiko untuk membagi pasukannya di hadapan kekuatan musuh yang jauh lebih besar menghasilkan kemenangan Konfederasi yang signifikan.Kemenangan tersebut, yang merupakan hasil dari keberanian Lee dan pengambilan keputusan yang malu-malu oleh Hooker, diimbangi oleh banyak korban jiwa, termasuk Letjen Thomas J. "Stonewall" Jackson.Jackson terkena tembakan ramah, sehingga lengan kirinya harus diamputasi.Dia meninggal karena pneumonia delapan hari kemudian, sebuah kehilangan yang Lee ibaratkan seperti kehilangan lengan kanannya.