Պերակի սուլթանությունը հիմնադրվել է 16-րդ դարի սկզբին Պերակ գետի ափին Մազաֆար Շահ I-ի կողմից՝ Մալաքայի 8-րդ սուլթան Մահմուդ Շահի ավագ որդու կողմից։1511 թվականին պորտուգալացիների կողմից Մալակկայի գրավումից հետո Մուզաֆար Շահը ապաստան է փնտրում Սումատրա նահանգի Սիակ քաղաքում՝ նախքան Պերակում գահ բարձրանալը։Նրա Փերակի սուլթանության ստեղծմանը նպաստել են տեղի ղեկավարները, այդ թվում՝ Թուն Սաբանը։Նոր սուլթանության օրոք Պերակի վարչակազմն ավելի կազմակերպված դարձավ՝ ելնելով դեմոկրատական ​​Մալակկայում կիրառվող ֆեոդալական համակարգից:Քանի որ 16-րդ դարը զարգանում էր, Պերակը դարձավ անագի հանքաքարի էական աղբյուր՝ գրավելով տարածաշրջանային և միջազգային առևտրականներին:Այնուամենայնիվ, սուլթանության վերելքը գրավեց Աչեի հզոր սուլթանության ուշադրությունը, ինչը հանգեցրեց լարվածության և փոխազդեցության շրջանի:1570-ականների ընթացքում Աչեհը համառորեն հետապնդում էր Մալայական թերակղզու որոշ հատվածներ:1570-ականների վերջերին Աչեի ազդեցությունն ակնհայտ էր, երբ Պերակի սուլթան Մանսուր Շահ I-ը առեղծվածային կերպով անհետացավ, ինչը խթանեց Աչեհի ուժերի կողմից նրա առևանգման մասին ենթադրությունները:Դա հանգեցրեց նրան, որ սուլթանի ընտանիքը գերի տարվեց Սումատրա:Արդյունքում, Պերակը կարճ ժամանակ գտնվեց Աչենի տիրապետության տակ, երբ Աչենյան արքայազնը բարձրացավ Պերակի գահին որպես սուլթան Ահմադ Թաջուդդին Շահ։Այնուամենայնիվ, չնայած Աչեի ազդեցությանը, Պերակը մնաց ինքնավար՝ դիմակայելով ինչպես Աչեհի, այնպես էլ Սիամաների վերահսկողությանը:Աչեհի տիրապետությունը Պերակի վրա սկսեց թուլանալ 17-րդ դարի կեսերին Հոլանդական Արևելյան Հնդկաստանի ընկերության (VOC) ժամանումից հետո:Aceh-ը և VOC-ը պայքարում էին Պերակի շահութաբեր անագի առևտրի նկատմամբ վերահսկողության համար:1653 թվականին նրանք փոխզիջման են եկել՝ ստորագրելով պայմանագիր, որը հոլանդացիներին շնորհում է բացառիկ իրավունքներ Պերակի թիթեղի նկատմամբ։17-րդ դարի վերջին, Ջոհոր սուլթանության անկման հետ մեկտեղ, Պերակը հայտնվեց որպես մալական տոհմի վերջին ժառանգորդը, բայց նա բախվեց ներքին բախումների, ներառյալ 40-ամյա քաղաքացիական պատերազմը 18-րդ դարում թիթեղյա եկամուտների պատճառով:Այս խռովությունը ավարտվեց 1747 թվականին հոլանդացիների հետ կնքված պայմանագրով, որով ճանաչվեց նրանց մենաշնորհը անագի առևտրի վրա։