Անվտանգ հռոմեական տիրապետության երկար ժամանակաշրջանից հետո 320-ական թվականներից Պանոնիան կրկին հաճախակի պատերազմի մեջ էր արևելյան գերմանական և սարմատական ​​ժողովուրդների հետ հյուսիսից և արևելքից:Ե՛վ վանդալները, և՛ գոթերը արշավեցին գավառով, պատճառելով հսկայական ավերածություններ։^[6] Հռոմեական կայսրության բաժանումից հետո Պանոնիան մնաց Արևմտյան Հռոմեական կայսրության տիրապետության տակ, թեև Սիրմիումի շրջանն իրականում ավելի շատ Արևելքի ազդեցության գոտում էր։Քանի որ գավառի լատինական բնակչությունը փախչում էր բարբարոսների շարունակական ներխուժումներից ^[7] , Դանուբի եզրին սկսեցին հայտնվել Հունական խմբեր։375 թվականին քոչվոր հոները սկսեցին ներխուժել Եվրոպա արևելյան տափաստաններից՝ հրահրելով գաղթի մեծ դարաշրջանը։380 թվականին հոները ներթափանցեցին ներկայիս Հունգարիա և մինչև 5-րդ դարը կարևոր գործոն մնացին տարածաշրջանում:Պանոնիայի նահանգները տուժել են միգրացիոն ժամանակաշրջանից սկսած 379 թվականից, Գոթ-Ալան-Հուն դաշնակցի բնակեցումը բազմիցս լուրջ ճգնաժամեր և ավերածություններ է առաջացրել, ժամանակակիցները այն բնութագրել են որպես պաշարման վիճակ, Պանոնիան դարձել է ներխուժման միջանցք ինչպես հյուսիսում, այնպես էլ Հայաստանում։ Հարավ.Հռոմեացիների փախուստն ու արտագաղթը սկսվեց երկու ծանր տասնամյակներից հետո՝ 401 թվականին, ինչը նաև անկում առաջացրեց աշխարհիկ և եկեղեցական կյանքում:Հունների հսկողությունը աստիճանաբար ընդլայնվեց Պանոնիայի վրա 410 թվականից, վերջապես Հռոմեական կայսրությունը վավերացրեց Պանոնիայի հանձնումը 433 թվականին պայմանագրով: Հռոմեացիների փախուստը և արտագաղթը Պանոնիայից շարունակվեց առանց ընդհատումների մինչև ավարների ներխուժումը:Հունները, օգտվելով գոթերի հեռանալուց, Քուադին և այլք, 423 թվականին ստեղծեցին նշանակալի կայսրություն՝ հիմնված Հունգարիայում։453 թվականին նրանք հասան իրենց ընդլայնման գագաթնակետին հայտնի նվաճող Աթիլա Հունի օրոք։Կայսրությունը փլուզվեց 455 թվականին, երբ հոները ջախջախվեցին հարևան գերմանական ցեղերից (օրինակ՝ Քուադի, Գեպիդի և Սկիրի)։